More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1542 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0326359  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1029  phosphate uptake regulator, PhoU  41.36 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1091  phosphate uptake regulator, PhoU  41.36 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.861563  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0156  phosphate uptake regulator, PhoU  37 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000017852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  30.29 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  30.88 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.07 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  31.03 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  30.09 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  29.13 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  30.65 
 
 		 220 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  31.07 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  29.91 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  29.09 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  29.09 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  30.1 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  28.37 
 
 		 234 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  28.92 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  31.73 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  29.41 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  26.94 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  30.26 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  29.81 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  29.52 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  28.16 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.52 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  25.84 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  27.45 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  25 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  26.11 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  26.6 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  27.27 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  25.76 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  25.6 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  28.5 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  24.51 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  24.02 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  28.02 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  26.46 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  24.88 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  24.88 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  25.49 
 
 		 216 aa  92  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  24.88 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  28.43 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  26.32 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  26.32 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  24.88 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  24.88 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  26.32 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  26.44 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  26.32 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  29.27 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  28.08 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  23.04 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  26.34 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  26.57 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0745  phosphate uptake regulator, PhoU  25.48 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133357  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  26.32 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  25.84 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  22.55 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  25.84 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  25.84 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  24.63 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  22.55 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  28.12 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  26.76 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  26.76 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  26.76 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  26.76 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  26.76 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  26.76 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  26.76 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  26.76 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  26.76 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  24.75 
 
 		 218 aa  89.7  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  26.7 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  26.21 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  26.21 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  24.88 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  25.6 
 
 		 239 aa  89  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2279  phosphate uptake regulator, PhoU  26.24 
 
 		 216 aa  89  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.5 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  24.4 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.5 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  27.15 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  25.35 
 
 		 220 aa  88.6  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  29.41 
 
 		 237 aa  88.6  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  26.32 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.79 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  26.32 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  26.7 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  26.4 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  23.7 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  27.18 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  26.7 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  26.57 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  26.13 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>