205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0378 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0378  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.735955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03186  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  99.56 
 
 		 225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0378  peptidase A24A prepilin type IV  99.56 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3529  type 4 prepilin peptidase  99.56 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.645409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03137  hypothetical protein  99.56 
 
 		 225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  36.82 
 
 		 283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.5 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  36.11 
 
 		 281 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  51.08 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  51.85 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  38.61 
 
 		 302 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  51.77 
 
 		 283 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  52.82 
 
 		 283 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  48.2 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  50 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  51.88 
 
 		 291 aa  121  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  44.83 
 
 		 303 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  48.65 
 
 		 318 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  45.34 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  50 
 
 		 300 aa  118  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  51.56 
 
 		 282 aa  118  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  52.17 
 
 		 288 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  34.46 
 
 		 295 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  51.45 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  42.78 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  49.23 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  51.45 
 
 		 288 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  45.45 
 
 		 304 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  44.03 
 
 		 303 aa  112  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  54.92 
 
 		 287 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.17 
 
 		 293 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  45.45 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  45.45 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  46.81 
 
 		 296 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  37.55 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  49.64 
 
 		 294 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  44.7 
 
 		 304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  50.78 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3638  type III leader peptidase  45.32 
 
 		 155 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3746  type III leader peptidase  45.32 
 
 		 155 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00764822  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3809  type III leader peptidase  45.32 
 
 		 155 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00060894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3638  leader peptidase HopD  45.71 
 
 		 155 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000886735  normal  0.214059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3711  leader peptidase HopD  45.71 
 
 		 155 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00474586  normal  0.728501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  38.74 
 
 		 303 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  34.55 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  45.27 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  49.41 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  50.68 
 
 		 293 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.01 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  46.48 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0013  Peptidase A24 N- domain protein  51.95 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.846368 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  56.03 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  47.29 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  47.29 
 
 		 303 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  47.29 
 
 		 303 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  46.51 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  47.66 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  45.45 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  46.21 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  34.13 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  46.48 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  45.45 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  45.45 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  45.19 
 
 		 287 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  45.19 
 
 		 287 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  34.57 
 
 		 283 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  41.21 
 
 		 290 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  45.45 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  52.27 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  49.24 
 
 		 308 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  49.02 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  31.06 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  45.77 
 
 		 293 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3806  A24 family peptidase  41.3 
 
 		 155 aa  99  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000259026  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0861  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.67 
 
 		 298 aa  98.6  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  46.67 
 
 		 297 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4222  Prepilin peptidase  38.89 
 
 		 321 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  45.99 
 
 		 308 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  48.2 
 
 		 301 aa  96.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4646  peptidase, A24 (type IV prepilin peptidase) family  40.58 
 
 		 155 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000049764  normal  0.0336249 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3618  A24 family peptidase  40.58 
 
 		 155 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960523  hitchhiker  0.00521455 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  34.39 
 
 		 287 aa  95.5  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  34.84 
 
 		 287 aa  95.5  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1134  type IV pilus prepilin peptidase PilD  47.73 
 
 		 351 aa  95.1  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3529  peptidase A24 N- domain-containing protein  47.73 
 
 		 351 aa  94.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2533  type IV pilus prepilin peptidase PilD  47.73 
 
 		 304 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0455  type IV pilus prepilin peptidase PilD  47.73 
 
 		 304 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1313  type IV pilus prepilin peptidase PilD  47.73 
 
 		 304 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3508  type IV prepilin leader peptidase  47.73 
 
 		 304 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3533  type IV prepilin leader peptidase  47.73 
 
 		 304 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3249  type IV pilus prepilin peptidase PilD  47.73 
 
 		 304 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  48.48 
 
 		 308 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  48.48 
 
 		 309 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  39.09 
 
 		 289 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0304  prepilin peptidase  48.41 
 
 		 311 aa  92.4  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.194253 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0184  peptidase A24A, prepilin type IV  40.54 
 
 		 166 aa  92.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0397814  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  45.77 
 
 		 294 aa  92  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  50.76 
 
 		 290 aa  92  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34 
 
 		 299 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>