124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1743 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1743  benzoate membrane transport protein  100 
 
 		 92 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000316549  unclonable  7.90007e-22 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  96.74 
 
 		 391 aa  177  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  96.74 
 
 		 391 aa  177  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  96.74 
 
 		 391 aa  177  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  96.74 
 
 		 391 aa  177  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  95.65 
 
 		 422 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  94.57 
 
 		 422 aa  174  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  78.82 
 
 		 392 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  77.65 
 
 		 392 aa  129  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  77.65 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  77.65 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1981  benzoate transporter  71.76 
 
 		 388 aa  126  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4590  benzoate transporter  60.87 
 
 		 394 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4269  benzoate transporter  62.35 
 
 		 394 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1641  benzoate transporter  58.44 
 
 		 392 aa  92.8  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0221313  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2230  benzoate transporter  61.11 
 
 		 397 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3994  benzoate transporter  53.66 
 
 		 395 aa  88.2  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000979992  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3908  benzoate transporter  52.5 
 
 		 402 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00157906  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3257  benzoate transporter  51.25 
 
 		 403 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00676766  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3137  benzoate transporter  49.41 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2678  benzoate transporter  48.81 
 
 		 396 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0431  benzoate transporter  50.63 
 
 		 421 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0927  benzoate transporter  50 
 
 		 395 aa  80.9  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4140  benzoate transporter  47.31 
 
 		 411 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2253  benzoate transporter  48.24 
 
 		 403 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2103  benzoate transporter  48.24 
 
 		 403 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36671 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5676  benzoate membrane transport protein  48.24 
 
 		 403 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2373  benzoate transporter  48.24 
 
 		 403 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0943  benzoate transporter  48.24 
 
 		 402 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1722  benzoate transporter  48.24 
 
 		 403 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.982368  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2334  benzoate transporter  48.24 
 
 		 403 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2357  benzoate transporter  48.24 
 
 		 403 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0179  benzoate transporter  48.75 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1229  benzoate transporter  48.24 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.803319  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1328  benzoate transport protein  47.06 
 
 		 481 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0713293  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1144  benzoate membrane transport protein  48.81 
 
 		 408 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0963  benzoate transport protein  47.06 
 
 		 405 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5243  benzoate transporter  42.35 
 
 		 398 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1938  benzoate transport protein  47.06 
 
 		 405 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3317  benzoate membrane transport protein  47.06 
 
 		 406 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1014  benzoate transporter  47.06 
 
 		 405 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0851  benzoate transporter  47.06 
 
 		 405 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1168  benzoate transporter  47.06 
 
 		 405 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1176  benzoate transporter  47.06 
 
 		 405 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0297  benzoate transporter  47.06 
 
 		 405 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2976  benzoate membrane transport protein  41.38 
 
 		 440 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5995  benzoate transporter  47.5 
 
 		 393 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202849 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4316  benzoate transporter  42.53 
 
 		 400 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.860854  hitchhiker  0.000181126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3710  benzoate transporter  45.88 
 
 		 418 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4540  benzoate transporter  50 
 
 		 395 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5095  benzoate transporter  42.35 
 
 		 400 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149673  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0320  benzoate transporter  50.65 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1567  benzoate transporter  45.88 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3246  benzoate transporter  42.35 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.334236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2303  benzoate transporter  43.48 
 
 		 421 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0629  benzoate transporter  49.35 
 
 		 398 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2321  benzoate transporter  44.71 
 
 		 390 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1839  benzoate membrane transport protein  45.24 
 
 		 397 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.25228  normal  0.411896 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0325  benzoate transporter  46.25 
 
 		 386 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.072313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3699  benzoate transporter  46.25 
 
 		 398 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4997  benzoate transporter  41.18 
 
 		 402 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5863  benzoate transporter  41.18 
 
 		 402 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0322  benzoate transporter  47.5 
 
 		 395 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000013011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0985  benzoate transporter  44.71 
 
 		 413 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0295  benzoate transporter  44.71 
 
 		 388 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2031  benzoate transport C-terminal domain protein  42.86 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0884494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2316  benzoate membrane transport protein  44.71 
 
 		 401 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.688329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0425  benzoate transporter  45.68 
 
 		 395 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0329  benzoate transporter  45.68 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000780494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0324  benzoate transporter  45.68 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000364152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0328  benzoate transporter  46.25 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1820  benzoate transporter  47.62 
 
 		 398 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3891  benzoate transporter  47.62 
 
 		 396 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2107  benzoate transporter  43.53 
 
 		 393 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.07884  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3621  putative transporter  45.24 
 
 		 430 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43160  putative transporter  45.24 
 
 		 400 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.243206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1428  benzoate transporter  46.43 
 
 		 396 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1398  benzoate transporter  46.43 
 
 		 396 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1369  benzoate transporter  41.18 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00588057  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03311  benzoate transporter  56.25 
 
 		 70 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00208994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2035  benzoate transporter  48.24 
 
 		 404 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42070  Benzoate membrane transport protein  38.82 
 
 		 406 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3707  benzoate transporter  48.24 
 
 		 404 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0805  benzoate transporter  47.3 
 
 		 383 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  48.68 
 
 		 392 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2091  putative benzoate transporter, BenE  44.94 
 
 		 381 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0767  benzoate transporter  44.94 
 
 		 381 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5351  benzoate membrane transport protein  37.65 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1792  benzoate membrane transport protein  44.05 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1662  benzoate transporter  44.74 
 
 		 392 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2115  benzoate transport protein, putative  45.95 
 
 		 383 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63913  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2241  benzoate transporter  44.44 
 
 		 407 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.739572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3514  benzoate transporter  50.65 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0411  putative benzoate transporter protein  45.57 
 
 		 427 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  45.95 
 
 		 647 aa  65.1  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3247  benzoate transport protein  43.82 
 
 		 394 aa  64.7  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760281  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2805  benzoate transporter  40.22 
 
 		 399 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1661  benzoate transporter  41.38 
 
 		 418 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000324364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7276  benzoate transporter  53.33 
 
 		 434 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3526  benzoate transporter  56.25 
 
 		 477 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>