286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4914 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4914  outer membrane usher protein FimD, truncation  100 
 
 		 286 aa  587  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  99.3 
 
 		 878 aa  584  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  98.95 
 
 		 856 aa  583  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  99.3 
 
 		 878 aa  584  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  99.3 
 
 		 878 aa  584  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  98.95 
 
 		 878 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  98.6 
 
 		 863 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2118  fimbrial usher family protein  62.24 
 
 		 740 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.167309 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  62.24 
 
 		 871 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01463  hypothetical protein  61.54 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.559549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2141  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  61.54 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000830223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01475  hypothetical protein  61.54 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.690608  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1589  fimbrial usher family protein  61.54 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2152  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  61.19 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  54.51 
 
 		 877 aa  315  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  48.63 
 
 		 876 aa  279  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  48.78 
 
 		 833 aa  278  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  47.74 
 
 		 869 aa  275  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  47.74 
 
 		 869 aa  275  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  47.74 
 
 		 869 aa  276  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  47.74 
 
 		 869 aa  275  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  47.74 
 
 		 869 aa  275  9e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  47.74 
 
 		 869 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  47.39 
 
 		 867 aa  269  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  51.04 
 
 		 888 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  51.04 
 
 		 873 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  51.04 
 
 		 888 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  51.04 
 
 		 888 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  45.99 
 
 		 870 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  45.99 
 
 		 870 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  45.99 
 
 		 870 aa  261  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  45.99 
 
 		 870 aa  261  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0026  outer membrane usher protein FimD  50.69 
 
 		 888 aa  261  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0792355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  45.99 
 
 		 870 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  44.86 
 
 		 866 aa  252  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  44.52 
 
 		 866 aa  252  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  44.52 
 
 		 866 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.52 
 
 		 866 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  44.52 
 
 		 866 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  44.52 
 
 		 866 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  43.84 
 
 		 866 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  47.15 
 
 		 842 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  47.15 
 
 		 842 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  46.77 
 
 		 842 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.75 
 
 		 837 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  42.91 
 
 		 851 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  45.33 
 
 		 840 aa  235  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  42.36 
 
 		 809 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  42.36 
 
 		 809 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  42.36 
 
 		 809 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  42.36 
 
 		 809 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  42.01 
 
 		 809 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5161  fimbrial usher protein  41.38 
 
 		 844 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  42.55 
 
 		 839 aa  219  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  42.2 
 
 		 840 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.22 
 
 		 851 aa  211  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0207  outer membrane usher protein FimD  40.48 
 
 		 848 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0190  outer membrane usher protein FimD  40.48 
 
 		 848 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.536682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0194  outer membrane usher protein FimD  40.48 
 
 		 848 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.931496 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  40.14 
 
 		 848 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  40.14 
 
 		 848 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.5 
 
 		 838 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  37.5 
 
 		 863 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  37.5 
 
 		 838 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.5 
 
 		 838 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  37.5 
 
 		 838 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  37.5 
 
 		 838 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  37.5 
 
 		 838 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.58 
 
 		 871 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39 
 
 		 859 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  36.11 
 
 		 836 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  36.11 
 
 		 836 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  35.76 
 
 		 836 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  35.76 
 
 		 836 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1531  outer membrane usher protein PsaC precursor  34.72 
 
 		 823 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00459102  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2676  fimbrial usher protein  34.72 
 
 		 823 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.529958  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.35 
 
 		 861 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2757  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.38 
 
 		 823 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0084  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.1 
 
 		 818 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.6 
 
 		 831 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  36.07 
 
 		 839 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4882  outer membrane fimbrial usher protein  32.19 
 
 		 814 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.45 
 
 		 857 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.85 
 
 		 844 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.8 
 
 		 866 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  33.46 
 
 		 837 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  34.9 
 
 		 901 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.9 
 
 		 901 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.19 
 
 		 884 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.58 
 
 		 837 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.82 
 
 		 851 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  32.63 
 
 		 833 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  34.39 
 
 		 839 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.48 
 
 		 963 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  32.2 
 
 		 850 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.81 
 
 		 832 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.82 
 
 		 852 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  31.36 
 
 		 833 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  31.36 
 
 		 833 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.62 
 
 		 880 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>