More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0940 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
350 aa  702    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0178  dihydroorotate dehydrogenase 2  84.86 
 
 
350 aa  609  1e-173  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.69 
 
 
355 aa  387  1e-106  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  44.64 
 
 
348 aa  292  6e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.74 
 
 
362 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.05 
 
 
354 aa  270  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.89 
 
 
364 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.35 
 
 
364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.17 
 
 
364 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.2 
 
 
367 aa  264  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.26 
 
 
362 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  42.43 
 
 
348 aa  263  4e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.2 
 
 
362 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.65 
 
 
363 aa  259  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.14 
 
 
354 aa  258  8e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.49 
 
 
364 aa  258  9e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.49 
 
 
364 aa  258  9e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.89 
 
 
364 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.74 
 
 
352 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.17 
 
 
357 aa  258  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.31 
 
 
355 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.99 
 
 
364 aa  256  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  40.36 
 
 
374 aa  256  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.31 
 
 
364 aa  255  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.97 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.97 
 
 
354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.4 
 
 
356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.14 
 
 
352 aa  252  8.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  38.16 
 
 
384 aa  251  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.54 
 
 
364 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.24 
 
 
364 aa  249  4e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.41 
 
 
349 aa  249  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.46 
 
 
348 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.8 
 
 
359 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.79 
 
 
362 aa  246  3e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.5 
 
 
363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.89 
 
 
363 aa  245  9e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  38.68 
 
 
356 aa  242  9e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.24 
 
 
357 aa  238  8e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.81 
 
 
356 aa  238  9e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  40.35 
 
 
361 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.32 
 
 
358 aa  237  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.57 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.73 
 
 
352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.5 
 
 
360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  37.54 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.72 
 
 
358 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  39.15 
 
 
357 aa  232  8.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.9 
 
 
358 aa  232  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.79 
 
 
377 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.42 
 
 
336 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  40.3 
 
 
336 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0409  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.34 
 
 
336 aa  228  1e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.845411  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.25 
 
 
336 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.43 
 
 
340 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  38.94 
 
 
348 aa  227  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.3 
 
 
344 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.56 
 
 
335 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.45 
 
 
347 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.67 
 
 
359 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  39.08 
 
 
356 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.72 
 
 
361 aa  227  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.45 
 
 
347 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  39.14 
 
 
335 aa  225  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  37.15 
 
 
367 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  37.57 
 
 
456 aa  223  3e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  37.68 
 
 
349 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.01 
 
 
358 aa  222  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.92 
 
 
339 aa  222  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.85 
 
 
340 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0118  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.49 
 
 
357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.469691  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.65 
 
 
336 aa  220  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.65 
 
 
336 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.1 
 
 
356 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.04 
 
 
337 aa  220  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.1 
 
 
356 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.1 
 
 
356 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.17 
 
 
347 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.12 
 
 
336 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.21 
 
 
364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  41.61 
 
 
336 aa  219  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.02 
 
 
361 aa  219  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.72 
 
 
357 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.12 
 
 
341 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  35.36 
 
 
361 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  38 
 
 
352 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.3 
 
 
356 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.3 
 
 
356 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.35 
 
 
335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.96 
 
 
352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.01 
 
 
344 aa  216  4e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  40.85 
 
 
336 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.92 
 
 
364 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.61 
 
 
339 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.94 
 
 
333 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.99 
 
 
345 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  40 
 
 
339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.12 
 
 
339 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  40 
 
 
339 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  40 
 
 
339 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>