54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_B0011 on replicon NC_011350
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 379 aa  770    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  43.75 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  42.3 
 
 		 425 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  42.01 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  42.66 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  24 
 
 		 398 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  29.34 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  25.14 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  25.87 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  26.24 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  26.95 
 
 		 395 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  28.08 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  27.09 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  27.09 
 
 		 395 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  27.09 
 
 		 395 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  27.08 
 
 		 400 aa  132  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  27.46 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  27.17 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  25.97 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  26.91 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  26.81 
 
 		 396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  24.61 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  26.51 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  26.51 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  26.26 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  28.08 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  26.46 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  23.85 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  25.51 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  26.8 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  25.07 
 
 		 450 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  30.75 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  30.6 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0380  general secretion pathway protein L  22.36 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3527  general secretion pathway protein L  22.05 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  23.73 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0380  general secretion pathway protein L  22.05 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  0.594502 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03184  general secretory pathway component, cryptic  22.05 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03135  hypothetical protein  22.05 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4243  general secretion pathway L  25.29 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.07387 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  22.04 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  22.31 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  21.77 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  26.2 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  22.04 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  23.32 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  24.18 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  20.4 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  25.63 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  26.27 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  21.34 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0539  hypothetical protein  34.21 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1053  general secretion pathway protein L  22.48 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  20.26 
 
 		 280 aa  43.1  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>