39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2574 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 156 aa  323  5e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  83.57 
 
 		 144 aa  241  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  41.13 
 
 		 140 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.73 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.7 
 
 		 293 aa  95.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.2 
 
 		 297 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  39.71 
 
 		 276 aa  87.4  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.96 
 
 		 286 aa  84  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.53 
 
 		 279 aa  81.6  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1100  hypothetical protein  39.57 
 
 		 159 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.430581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  31.06 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  31.3 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.29 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.32 
 
 		 406 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3480  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  30.84 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.29 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.38 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7201  hypothetical protein  32.48 
 
 		 194 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  36.27 
 
 		 413 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10651  hypothetical protein  34.38 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.999834  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0506  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.46 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.12 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0414  hypothetical protein  29.41 
 
 		 194 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07551  hypothetical protein  31.36 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.113858  normal  0.0161403 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  35.71 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0124  hypothetical protein  31.36 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  25.62 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4043  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.38 
 
 		 394 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1335  hypothetical protein  26.52 
 
 		 250 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  36.21 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1182  purine deoxyribosyltransferase  36.49 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0547  hypothetical protein  29.06 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0433  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase superfamily protein  31.3 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485819  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.86 
 
 		 185 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  32 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  29.13 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0242  hypothetical protein  28.45 
 
 		 200 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14861  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.85 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0740611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>