More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0091 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0091  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0564705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1753  50S ribosomal protein L5  92.74 
 
 
179 aa  345  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0672  50S ribosomal protein L5  90.5 
 
 
179 aa  342  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  87.71 
 
 
179 aa  331  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2053  50S ribosomal protein L5  73.18 
 
 
179 aa  290  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00300411  normal  0.056988 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2762  50S ribosomal protein L5  70.39 
 
 
179 aa  283  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  4.6872e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 
179 aa  249  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.891e-13  hitchhiker  1.42331e-08 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 
179 aa  245  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 
179 aa  239  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  7.13607e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  59.22 
 
 
179 aa  237  6e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 
179 aa  235  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 
179 aa  235  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 
179 aa  234  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 
179 aa  233  8e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 
179 aa  232  2e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.57124e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 
179 aa  232  2e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.21875e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
179 aa  232  2e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
180 aa  231  4e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 
179 aa  230  8e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.26613e-05  unclonable  1.44866e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 
179 aa  230  8e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.74066e-07  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 
179 aa  230  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  3.84321e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 
179 aa  230  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.6821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 
179 aa  230  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.41034e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 
184 aa  229  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.09145e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 
179 aa  229  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 
179 aa  229  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
181 aa  229  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 
179 aa  229  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.50399e-07  hitchhiker  1.69962e-09 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 
179 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.08905e-07  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  229  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  1.40666e-07  unclonable  3.31495e-12 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 
179 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.74213e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 
179 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.87667e-07  unclonable  8.89639e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 
179 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.53128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.10602e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
180 aa  228  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.42561e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.84973e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 
178 aa  228  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  5.8995e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.4971e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.67515e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
179 aa  228  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  228  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  3.3393e-09  unclonable  8.47343e-06 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
180 aa  228  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.05231e-10  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 
179 aa  228  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  9.73841e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  228  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  3.87746e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  228  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.06117e-06  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  58.76 
 
 
184 aa  227  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  227  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  3.91972e-07  unclonable  1.25829e-08 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
179 aa  227  8e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 
179 aa  227  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67314e-10 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  57.95 
 
 
223 aa  225  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
179 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  1.59394e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 
180 aa  225  3e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  2.7583e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
198 aa  225  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  54.75 
 
 
179 aa  225  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.73991e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 
179 aa  225  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.28056e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
180 aa  224  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 
179 aa  224  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.16279e-08  unclonable  5.74011e-11 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  58.86 
 
 
180 aa  224  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.36649e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 
179 aa  224  5e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  58.43 
 
 
187 aa  224  5e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 
179 aa  224  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.13261e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 
179 aa  224  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  5.38083e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 
179 aa  224  7e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0393  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
179 aa  223  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00978346  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
180 aa  223  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  8.32727e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 
180 aa  223  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 
179 aa  223  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  58.52 
 
 
183 aa  223  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0385  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
179 aa  223  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  3.34346e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  58.43 
 
 
179 aa  222  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  1.38257e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 
179 aa  222  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.51494e-08  hitchhiker  2.15768e-06 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 
179 aa  222  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 
179 aa  222  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 
179 aa  222  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
180 aa  221  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  1.81617e-05 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 
185 aa  222  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 
179 aa  221  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  3.06823e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 
179 aa  221  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  8.23313e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  52.51 
 
 
179 aa  221  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 
179 aa  221  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.88699e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0768  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 
180 aa  221  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0251429  normal  0.0345896 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  55.62 
 
 
179 aa  221  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 
182 aa  221  5e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  52.51 
 
 
179 aa  221  5e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  5.68765e-09  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  56 
 
 
181 aa  221  5e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 
179 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 
179 aa  220  7e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0613  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
179 aa  220  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554021  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
183 aa  220  7e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 
180 aa  220  7e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.53221e-28 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  54.49 
 
 
179 aa  220  8e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  220  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  220  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
180 aa  220  9e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.63356e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 
182 aa  219  1e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 
191 aa  219  1e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  55.62 
 
 
180 aa  219  1e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.55601e-08  normal  0.102158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>