More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1753 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1753  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 179 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0091  50S ribosomal protein L5  92.74 
 
 		 179 aa  345  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0564705 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0672  50S ribosomal protein L5  87.71 
 
 		 179 aa  332  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  83.24 
 
 		 179 aa  318  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2053  50S ribosomal protein L5  72.07 
 
 		 179 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00300411  normal  0.056988 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2762  50S ribosomal protein L5  69.27 
 
 		 179 aa  274  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000046872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  231  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 180 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 182 aa  225  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 178 aa  226  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 198 aa  223  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 183 aa  221  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  221  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 184 aa  222  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 184 aa  221  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  56 
 
 		 181 aa  221  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  221  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0445  50S ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 179 aa  220  7e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0266949  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  54.75 
 
 		 179 aa  220  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 181 aa  220  8e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 180 aa  220  9e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 182 aa  220  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 180 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  58.14 
 
 		 180 aa  220  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 180 aa  219  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0768  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0251429  normal  0.0345896 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0506  50S ribosomal protein L5  53.37 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0585941  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  53.37 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  217  6e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 223 aa  217  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 		 179 aa  217  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 187 aa  217  7e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  51.96 
 
 		 179 aa  217  8.999999999999998e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 		 179 aa  217  8.999999999999998e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 179 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 191 aa  216  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 180 aa  216  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  55.29 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  53.41 
 
 		 191 aa  215  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  215  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 182 aa  215  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  53.93 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  54.29 
 
 		 192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>