More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0672 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0672  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0091  50S ribosomal protein L5  90.5 
 
 		 179 aa  342  1e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0564705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1753  50S ribosomal protein L5  87.71 
 
 		 179 aa  332  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  86.03 
 
 		 179 aa  323  9e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2053  50S ribosomal protein L5  71.51 
 
 		 179 aa  281  4.0000000000000003e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00300411  normal  0.056988 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2762  50S ribosomal protein L5  70.95 
 
 		 179 aa  280  8.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000046872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  230  7.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  230  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 180 aa  222  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 183 aa  222  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 184 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 178 aa  222  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 184 aa  222  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 179 aa  221  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 223 aa  221  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 179 aa  221  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 180 aa  221  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 181 aa  220  9e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 180 aa  220  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 191 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 198 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  59.3 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 		 179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 		 179 aa  217  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 180 aa  217  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  52.51 
 
 		 179 aa  217  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  217  7.999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 184 aa  217  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 180 aa  217  8.999999999999998e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 180 aa  217  8.999999999999998e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 220 aa  216  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  54.86 
 
 		 192 aa  216  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  53.71 
 
 		 181 aa  216  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 180 aa  215  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0506  50S ribosomal protein L5  52.81 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0585941  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 		 182 aa  214  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  52.84 
 
 		 191 aa  214  7e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 187 aa  214  7e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  214  7e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  214  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 179 aa  213  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 		 179 aa  213  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 179 aa  213  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 183 aa  213  9e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 180 aa  213  9e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0445  50S ribosomal protein L5  52.81 
 
 		 179 aa  213  9e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0266949  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 		 179 aa  213  9e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000823313  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0340  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 181 aa  213  9e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 182 aa  213  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0768  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 		 180 aa  213  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0251429  normal  0.0345896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  53.37 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 		 182 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>