38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1737 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  511  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  46.39 
 
 
249 aa  218  7e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  42.37 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  44.4 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  45.54 
 
 
848 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  39.61 
 
 
247 aa  188  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  38.78 
 
 
247 aa  182  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  38.8 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  41.89 
 
 
804 aa  180  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  44.04 
 
 
1121 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  44.5 
 
 
1121 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  44.04 
 
 
1121 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  41.26 
 
 
250 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  37.71 
 
 
703 aa  175  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  38.22 
 
 
1112 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  39.29 
 
 
1143 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  35.8 
 
 
250 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  34.51 
 
 
250 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  36.44 
 
 
1174 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  30.59 
 
 
739 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  23.23 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  29.68 
 
 
739 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  25.6 
 
 
313 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  29.36 
 
 
1013 aa  58.9  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  25.54 
 
 
1306 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  25.99 
 
 
846 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  24.37 
 
 
252 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  26.12 
 
 
757 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.73 
 
 
864 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  25.22 
 
 
1310 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  27.6 
 
 
767 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  25.31 
 
 
1072 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3964  LamG domain-containing protein  28.41 
 
 
364 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.23 
 
 
11716 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  23.2 
 
 
1504 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  21.97 
 
 
316 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.27 
 
 
599 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3963  LamG domain-containing protein  28.41 
 
 
309 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.276199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>