More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1821 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  100 
 
 
157 aa  312  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  96.82 
 
 
157 aa  302  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  54.78 
 
 
157 aa  169  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  53.5 
 
 
170 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  53.19 
 
 
144 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  47.65 
 
 
151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  50.7 
 
 
141 aa  130  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  49.29 
 
 
143 aa  126  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  48.59 
 
 
141 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  49.17 
 
 
143 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  49.17 
 
 
143 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  48.59 
 
 
141 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  47.83 
 
 
164 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  47.48 
 
 
139 aa  123  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  48.65 
 
 
145 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  47.37 
 
 
137 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  46.04 
 
 
143 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  43.61 
 
 
137 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  42.22 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  47.5 
 
 
143 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  41.73 
 
 
139 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  47.5 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  47.5 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  43.09 
 
 
143 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  43.09 
 
 
143 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  43.09 
 
 
143 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  43.57 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  46.67 
 
 
143 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  40.6 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  40.6 
 
 
138 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  49.64 
 
 
141 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  41.01 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  42.54 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  43.66 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  41.67 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  41.53 
 
 
138 aa  107  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  41.73 
 
 
148 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  45 
 
 
143 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  45 
 
 
143 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  45 
 
 
143 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  41.01 
 
 
142 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  43.88 
 
 
144 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  38.69 
 
 
145 aa  104  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  43.33 
 
 
143 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  43.33 
 
 
143 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  43.17 
 
 
142 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  44.17 
 
 
143 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  41.54 
 
 
136 aa  97.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  39.29 
 
 
139 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  38.85 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  39.29 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  38.13 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  38.57 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  40 
 
 
139 aa  95.5  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  38.73 
 
 
142 aa  95.5  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  40 
 
 
139 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  40 
 
 
139 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  39.83 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  40.71 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  38.57 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  39.29 
 
 
139 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  36.88 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  39.32 
 
 
144 aa  91.7  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  44.63 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  38.57 
 
 
139 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  39.29 
 
 
144 aa  91.3  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  38.57 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  39.22 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  42.14 
 
 
138 aa  90.5  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  42.65 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  39.13 
 
 
142 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  37.86 
 
 
139 aa  87.8  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 
139 aa  87.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3488  CBS domain-containing protein  37.12 
 
 
142 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  39.2 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  42 
 
 
125 aa  85.5  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  38.66 
 
 
145 aa  84  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  42.74 
 
 
141 aa  84  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  36.96 
 
 
138 aa  84  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  36.5 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  34.06 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  34.92 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  36.11 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  35.25 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  39.17 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  32.76 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  33.9 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  35.11 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  36.57 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  39.17 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  35.54 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  44.66 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  44.66 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  42.98 
 
 
216 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  35.07 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>