More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1250 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 464 aa  954    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  62.14 
 
 		 464 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  59.57 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  54.37 
 
 		 436 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  53.1 
 
 		 443 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  51.54 
 
 		 441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  44.13 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  43.49 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  43.69 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  43.46 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  43.44 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  43.33 
 
 		 434 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  45.24 
 
 		 454 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  42.14 
 
 		 436 aa  356  5.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  45.05 
 
 		 443 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  43.06 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  42.92 
 
 		 458 aa  353  5e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  42.32 
 
 		 434 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  38.68 
 
 		 440 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.92 
 
 		 461 aa  338  9e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  40.09 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  40.33 
 
 		 450 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  40.7 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  38.02 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  41 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  39.2 
 
 		 430 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  41.71 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  40.87 
 
 		 422 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  41 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  40.61 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  40.14 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  40.85 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  40.85 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  40.85 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  40.85 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  41.23 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  40.85 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  41.23 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  39.82 
 
 		 451 aa  316  5e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  39.15 
 
 		 420 aa  312  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  37.39 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  39.36 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  38.97 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  39.85 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  38.97 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  40.28 
 
 		 448 aa  308  9e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  40.28 
 
 		 448 aa  308  9e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  42.07 
 
 		 442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  41.91 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  36.72 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  40.71 
 
 		 432 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  39.41 
 
 		 438 aa  300  5e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  37.97 
 
 		 428 aa  300  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  41.13 
 
 		 432 aa  300  5e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  38.35 
 
 		 465 aa  299  8e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  38.22 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  37.1 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  38.19 
 
 		 422 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.67 
 
 		 429 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  38.1 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  38.35 
 
 		 428 aa  295  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  36.97 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 		 432 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  38.96 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  38.34 
 
 		 432 aa  294  3e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  40.49 
 
 		 450 aa  294  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  38.5 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 		 432 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  37.64 
 
 		 426 aa  293  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  37.5 
 
 		 455 aa  293  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  40.33 
 
 		 439 aa  292  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  38.64 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  38.21 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  38.21 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  38.87 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  38.24 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  38.22 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  38.04 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  39.24 
 
 		 414 aa  290  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  40 
 
 		 448 aa  289  7e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  37.3 
 
 		 436 aa  289  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  37.94 
 
 		 422 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  37.97 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  37.5 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  38.27 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  38.27 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  38.27 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  38.27 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  38.27 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  37.31 
 
 		 418 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  37.94 
 
 		 422 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  38.27 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  36.87 
 
 		 435 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  38.02 
 
 		 434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  38.89 
 
 		 432 aa  286  4e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  38 
 
 		 425 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>