122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2362 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  100 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  54.29 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  53.33 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  52.86 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  48.54 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  42.38 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  41.86 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  38.91 
 
 		 240 aa  141  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  40.53 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  41.18 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  38.57 
 
 		 288 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  38.14 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  41.4 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  40.09 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  40.93 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  40 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  40.45 
 
 		 229 aa  124  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  40.72 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  40 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  39.17 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  40 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  37.89 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  41.78 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  39.55 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  38.68 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1206  urease accessory protein UreF  42.11 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  40 
 
 		 238 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  40.44 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  37.67 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  37.67 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  34.68 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  30.05 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  31.44 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  27.56 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  27.56 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  26.34 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  29.02 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  29.05 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  27.52 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  31.58 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  29.18 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  28.77 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  22.67 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  26.36 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  26.91 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  29.55 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  27.98 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  31.31 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  30.7 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  30.99 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  31.51 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  30.81 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  28.45 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  26.46 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  30.37 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  24.14 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  30.04 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  27.52 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  27.48 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  30.05 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  32.74 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  28.04 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  30.7 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  24.77 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  28.83 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  27.98 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19211  urease accessory protein UreF  25.23 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  31.86 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  29.15 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  28.11 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  27.98 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  30.23 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  27.65 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  25.79 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  29.77 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  24 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  25.34 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08901  urease accessory protein UreF  21.27 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.460278  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  28.84 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  26.34 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  29.77 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  29.77 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  29.77 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  25.89 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  29.44 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0831  urease accessory protein UreF  20.89 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  24.78 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  27.93 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1050  urease accessory protein ureF  25.68 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  26.7 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  28.63 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08881  urease accessory protein UreF  20.64 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.751902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  25.24 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  27.48 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  22.07 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  29.36 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  28.57 
 
 		 266 aa  52  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  28.97 
 
 		 226 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  27.85 
 
 		 233 aa  51.6  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  29.17 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.148323 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>