More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1238 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  48.98 
 
 		 978 aa  855    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  52.02 
 
 		 958 aa  938    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  48.98 
 
 		 978 aa  856    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  49.08 
 
 		 978 aa  869    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  72.57 
 
 		 932 aa  1419    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  66.27 
 
 		 923 aa  1245    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  49.03 
 
 		 974 aa  862    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  48.76 
 
 		 974 aa  855    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  100 
 
 		 928 aa  1915    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  48.98 
 
 		 973 aa  854    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  52.42 
 
 		 968 aa  957    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.01 
 
 		 974 aa  962    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  48.92 
 
 		 978 aa  855    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  48.12 
 
 		 981 aa  850    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  50.54 
 
 		 961 aa  910    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  49.25 
 
 		 953 aa  890    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  50.11 
 
 		 969 aa  909    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  49.73 
 
 		 978 aa  867    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  48.87 
 
 		 973 aa  852    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  47.87 
 
 		 979 aa  838    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  53.67 
 
 		 973 aa  929    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  49.26 
 
 		 981 aa  876    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  48.98 
 
 		 973 aa  854    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  48.98 
 
 		 973 aa  855    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  59.13 
 
 		 935 aa  1082    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  48.98 
 
 		 973 aa  855    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  24.54 
 
 		 858 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  28.3 
 
 		 833 aa  177  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0612  conserved hypothetical protein  35.43 
 
 		 1426 aa  165  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  26.96 
 
 		 817 aa  166  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0814  anaerobic dehydrogenase  33.45 
 
 		 1434 aa  162  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0197792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  27.9 
 
 		 812 aa  160  9e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  26 
 
 		 803 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  26.19 
 
 		 932 aa  156  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  27.26 
 
 		 837 aa  156  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  26.39 
 
 		 722 aa  155  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 		 856 aa  154  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  24.49 
 
 		 911 aa  154  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  24.37 
 
 		 992 aa  150  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  23.37 
 
 		 1066 aa  149  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  25.03 
 
 		 898 aa  149  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  21.91 
 
 		 934 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  25.82 
 
 		 1038 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  26.71 
 
 		 930 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  25.12 
 
 		 807 aa  147  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  24.48 
 
 		 781 aa  147  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1507  molybdopterin oxidoreductase  25.27 
 
 		 915 aa  144  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.498476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  24.85 
 
 		 803 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  24.65 
 
 		 1029 aa  141  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  25.5 
 
 		 917 aa  140  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  25.51 
 
 		 928 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  25.28 
 
 		 1155 aa  139  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  24.1 
 
 		 826 aa  138  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  29.13 
 
 		 784 aa  137  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1069  molydopterin dinucleotide-binding region  23.53 
 
 		 1027 aa  136  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345727 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  23.94 
 
 		 909 aa  136  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2959  molybdopterin oxidoreductase  24.1 
 
 		 913 aa  135  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791344  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  24.96 
 
 		 805 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0199  molybdopterin oxidoreductase  24.65 
 
 		 917 aa  134  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  26.71 
 
 		 927 aa  134  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  24.23 
 
 		 839 aa  134  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  22.94 
 
 		 951 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  32.52 
 
 		 891 aa  132  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1423  molydopterin dinucleotide-binding region  24.37 
 
 		 1064 aa  132  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.658184  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  24.96 
 
 		 805 aa  132  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  24.15 
 
 		 910 aa  132  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  22.17 
 
 		 731 aa  131  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.72 
 
 		 942 aa  131  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  21.06 
 
 		 826 aa  130  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  23.64 
 
 		 955 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2424  molydopterin dinucleotide-binding region  24.26 
 
 		 1064 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  24.19 
 
 		 765 aa  129  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  30.36 
 
 		 758 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  30.36 
 
 		 758 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  33.2 
 
 		 756 aa  127  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2934  formate dehydrogenase  29.96 
 
 		 953 aa  127  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  22.97 
 
 		 1020 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  30.36 
 
 		 758 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  23 
 
 		 1020 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  22.77 
 
 		 1020 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  30.36 
 
 		 758 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  22.97 
 
 		 1020 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  30.36 
 
 		 758 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  22.84 
 
 		 1022 aa  125  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  22.89 
 
 		 1020 aa  125  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  23.05 
 
 		 952 aa  124  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  25.54 
 
 		 733 aa  124  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  29.96 
 
 		 729 aa  124  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  31.17 
 
 		 747 aa  124  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  31.82 
 
 		 760 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  23.74 
 
 		 1148 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.46 
 
 		 864 aa  123  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  32.41 
 
 		 691 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  22.77 
 
 		 994 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0709241  normal  0.262694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  22.86 
 
 		 1031 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  30.83 
 
 		 760 aa  122  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  30.42 
 
 		 745 aa  122  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  32.77 
 
 		 759 aa  122  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  31.4 
 
 		 764 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  30.83 
 
 		 764 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>