More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1666 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
370 aa  768    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.71 
 
 
369 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.54 
 
 
373 aa  559  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.31 
 
 
375 aa  548  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.32 
 
 
372 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.3 
 
 
373 aa  541  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.39 
 
 
374 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.68 
 
 
373 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.11 
 
 
379 aa  522  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.39 
 
 
379 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.39 
 
 
379 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  67.95 
 
 
372 aa  519  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.31 
 
 
380 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.75 
 
 
379 aa  519  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.75 
 
 
379 aa  518  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.66 
 
 
379 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.66 
 
 
379 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.66 
 
 
379 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.66 
 
 
379 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.66 
 
 
379 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.66 
 
 
379 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.27 
 
 
357 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.66 
 
 
379 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.39 
 
 
379 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.39 
 
 
379 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.22 
 
 
380 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.33 
 
 
370 aa  506  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.81 
 
 
380 aa  498  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.67 
 
 
382 aa  495  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.33 
 
 
380 aa  496  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.64 
 
 
379 aa  493  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.05 
 
 
371 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.5 
 
 
369 aa  490  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.77 
 
 
370 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.15 
 
 
368 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.86 
 
 
384 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.45 
 
 
372 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.77 
 
 
372 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.56 
 
 
372 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.21 
 
 
373 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.58 
 
 
367 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.15 
 
 
368 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.91 
 
 
392 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.47 
 
 
394 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.52 
 
 
368 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.02 
 
 
380 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.1 
 
 
368 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.1 
 
 
368 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.26 
 
 
387 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.24 
 
 
336 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.13 
 
 
379 aa  443  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.26 
 
 
355 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.31 
 
 
392 aa  438  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.43 
 
 
369 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.05 
 
 
374 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.85 
 
 
392 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.03 
 
 
392 aa  435  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.75 
 
 
388 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.3 
 
 
381 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.46 
 
 
395 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.47 
 
 
379 aa  428  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.56 
 
 
385 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.93 
 
 
376 aa  428  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.26 
 
 
385 aa  428  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.02 
 
 
381 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.8 
 
 
373 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.05 
 
 
370 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.68 
 
 
375 aa  427  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.51 
 
 
374 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  56.47 
 
 
382 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.51 
 
 
374 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.79 
 
 
374 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.51 
 
 
374 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.44 
 
 
387 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.95 
 
 
365 aa  425  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.62 
 
 
387 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 
372 aa  422  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.42 
 
 
370 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.09 
 
 
384 aa  421  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 
371 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.9 
 
 
371 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.58 
 
 
383 aa  422  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.65 
 
 
387 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.99 
 
 
380 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  55.71 
 
 
371 aa  421  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.9 
 
 
371 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.09 
 
 
381 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.14 
 
 
377 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 
375 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 
375 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 
375 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.3 
 
 
383 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.65 
 
 
375 aa  418  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.03 
 
 
391 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 
375 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 
375 aa  419  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.65 
 
 
378 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 
375 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 
375 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.93 
 
 
370 aa  418  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>