More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0470 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  72.71 
 
 		 415 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  72.71 
 
 		 415 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 414 aa  841    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  72.46 
 
 		 415 aa  635    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  73.19 
 
 		 415 aa  640    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  73.67 
 
 		 437 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  73.67 
 
 		 415 aa  634  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  72.71 
 
 		 415 aa  634  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  72.46 
 
 		 415 aa  630  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  72.22 
 
 		 415 aa  628  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  69.88 
 
 		 415 aa  608  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  70.12 
 
 		 415 aa  610  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  70.6 
 
 		 415 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  69.88 
 
 		 416 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  70.6 
 
 		 449 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  68.99 
 
 		 421 aa  602  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  69.88 
 
 		 503 aa  595  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  69.62 
 
 		 418 aa  592  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  68.6 
 
 		 431 aa  589  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 419 aa  586  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  68.82 
 
 		 422 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  66.11 
 
 		 418 aa  578  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  66.11 
 
 		 418 aa  578  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  65.87 
 
 		 419 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  66.35 
 
 		 418 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1968  transcription termination factor Rho  64.14 
 
 		 435 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2835  transcription termination factor Rho  66.27 
 
 		 418 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  67.94 
 
 		 421 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  67.94 
 
 		 421 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  66.19 
 
 		 418 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  66.99 
 
 		 421 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  66.19 
 
 		 418 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2055  transcription termination factor Rho  65.23 
 
 		 419 aa  568  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.224008  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0056  transcription termination factor Rho  66.59 
 
 		 418 aa  569  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.624347  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0511  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  568  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0322242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 		 421 aa  568  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  65.79 
 
 		 450 aa  568  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  67.7 
 
 		 418 aa  570  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0037  transcription termination factor Rho  65.38 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.245355 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  570  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  568  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0180  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4034  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  64.86 
 
 		 424 aa  571  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2363  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 422 aa  569  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016195  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  66.99 
 
 		 421 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1824  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 422 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025276  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  66.99 
 
 		 422 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3081  transcription termination factor Rho  65.55 
 
 		 484 aa  567  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  65.38 
 
 		 419 aa  568  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  66.11 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  67.46 
 
 		 421 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  65.38 
 
 		 419 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  64.82 
 
 		 548 aa  567  1e-160  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1444  transcription termination factor Rho  64.66 
 
 		 420 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440911  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4203  transcription termination factor Rho  65.38 
 
 		 450 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  64.42 
 
 		 420 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  68.26 
 
 		 422 aa  567  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  66.99 
 
 		 421 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  66.51 
 
 		 421 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5130  transcription termination factor Rho  64.42 
 
 		 420 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923516  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  64.9 
 
 		 419 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0949  transcription termination factor Rho  64.66 
 
 		 420 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.545356 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  65.38 
 
 		 419 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0188  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 419 aa  565  1e-160  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6250  transcription termination factor Rho  64.42 
 
 		 420 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  67.55 
 
 		 436 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 433 aa  567  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  66.03 
 
 		 421 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  64.66 
 
 		 420 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0148  transcription termination factor Rho  64.9 
 
 		 419 aa  565  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00136527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00570  transcription termination factor Rho  64.9 
 
 		 421 aa  565  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.576624  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1767  transcription termination factor Rho  64.66 
 
 		 420 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1829  transcription termination factor Rho  64.42 
 
 		 420 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2998  transcription termination factor Rho  65.14 
 
 		 419 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0194587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  67.07 
 
 		 436 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2210  transcription termination factor Rho  64.18 
 
 		 420 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  64.18 
 
 		 420 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2532  transcription termination factor Rho  67.06 
 
 		 422 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  65.79 
 
 		 421 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  65.79 
 
 		 421 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0042  transcription termination factor Rho  63.94 
 
 		 420 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133554  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1855  transcription termination factor Rho  63.94 
 
 		 420 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  66.83 
 
 		 428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3217  transcription termination factor Rho  66.11 
 
 		 420 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>