More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4826 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 417 aa  858    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  73.56 
 
 		 412 aa  614  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  73.98 
 
 		 411 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  70.29 
 
 		 415 aa  610  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  70.74 
 
 		 413 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  70.74 
 
 		 413 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  72.39 
 
 		 412 aa  599  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  71.67 
 
 		 418 aa  598  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  70.26 
 
 		 413 aa  596  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  70.26 
 
 		 413 aa  595  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  70.26 
 
 		 413 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  70.02 
 
 		 414 aa  593  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  70.02 
 
 		 414 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  70.42 
 
 		 412 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  70.02 
 
 		 413 aa  591  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  70.02 
 
 		 413 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  70.42 
 
 		 412 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  69.78 
 
 		 414 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  69.49 
 
 		 416 aa  591  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  69.64 
 
 		 415 aa  588  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  69.54 
 
 		 413 aa  589  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  71.29 
 
 		 413 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  70.76 
 
 		 414 aa  586  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  68.32 
 
 		 420 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  67.99 
 
 		 413 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  69.98 
 
 		 413 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  68.81 
 
 		 410 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  69.48 
 
 		 415 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  68.32 
 
 		 410 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  67.66 
 
 		 415 aa  570  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  67.74 
 
 		 415 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  66.99 
 
 		 412 aa  565  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  67.99 
 
 		 415 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  69.23 
 
 		 417 aa  560  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  65.04 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 415 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  66.75 
 
 		 415 aa  557  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 415 aa  557  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  67.66 
 
 		 412 aa  554  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  66.5 
 
 		 413 aa  552  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  64.25 
 
 		 416 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  63.79 
 
 		 431 aa  545  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  65.51 
 
 		 411 aa  546  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  63.81 
 
 		 420 aa  543  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  66.58 
 
 		 412 aa  541  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  64.44 
 
 		 422 aa  539  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  63.39 
 
 		 415 aa  538  9.999999999999999e-153  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 429 aa  537  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  65.36 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  61.99 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  63.05 
 
 		 414 aa  536  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  64.32 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  64.41 
 
 		 412 aa  531  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  64.27 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  64.52 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  62.81 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  64.86 
 
 		 412 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  64.52 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 415 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 415 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 415 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 415 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 415 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 415 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 423 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  63.22 
 
 		 422 aa  525  1e-148  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 423 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  65.01 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 		 415 aa  524  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  61.84 
 
 		 415 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 		 431 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 423 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  61.08 
 
 		 435 aa  521  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  62.08 
 
 		 415 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 427 aa  524  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 		 431 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  61.99 
 
 		 419 aa  523  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 427 aa  521  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  63.03 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 424 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  59.65 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 427 aa  518  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  62.08 
 
 		 415 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  63.28 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  66.34 
 
 		 412 aa  518  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  63.77 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  58.51 
 
 		 414 aa  518  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  63.03 
 
 		 508 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 		 426 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 		 425 aa  519  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  62.13 
 
 		 410 aa  520  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  63.77 
 
 		 415 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>