More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2528 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  60.14 
 
 
596 aa  723    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  54.8 
 
 
582 aa  657    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  57.46 
 
 
636 aa  704    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  58.85 
 
 
615 aa  686    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  69.03 
 
 
579 aa  842    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  100 
 
 
580 aa  1182    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 
566 aa  596  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  50.61 
 
 
566 aa  594  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  48.52 
 
 
571 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  48.17 
 
 
571 aa  561  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.17 
 
 
571 aa  560  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  48.17 
 
 
571 aa  561  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.99 
 
 
571 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  48.17 
 
 
571 aa  561  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  48.17 
 
 
571 aa  561  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.17 
 
 
571 aa  561  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  48.17 
 
 
571 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  47.34 
 
 
584 aa  558  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  47.5 
 
 
572 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  47.82 
 
 
571 aa  555  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  47.5 
 
 
572 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  47.5 
 
 
572 aa  553  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  46.45 
 
 
572 aa  544  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  46.27 
 
 
572 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  44.97 
 
 
568 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  46.33 
 
 
575 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  46.15 
 
 
612 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  45.39 
 
 
572 aa  529  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  45.22 
 
 
610 aa  527  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  46.34 
 
 
576 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  44.7 
 
 
582 aa  524  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  44.7 
 
 
582 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  55.31 
 
 
468 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  46.86 
 
 
589 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  44.72 
 
 
567 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  44.37 
 
 
567 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  44.15 
 
 
582 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  42.73 
 
 
566 aa  498  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.76 
 
 
567 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  43.31 
 
 
565 aa  485  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  42.78 
 
 
577 aa  452  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.78 
 
 
598 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  39.51 
 
 
575 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  38.78 
 
 
598 aa  408  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.48 
 
 
586 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  37.31 
 
 
586 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.65 
 
 
586 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.13 
 
 
586 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.24 
 
 
586 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  37.13 
 
 
586 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  37.31 
 
 
586 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.59 
 
 
586 aa  399  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  40.44 
 
 
584 aa  399  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  39.55 
 
 
597 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  38.32 
 
 
578 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  38.32 
 
 
578 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  36.96 
 
 
586 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  37.86 
 
 
587 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.96 
 
 
586 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  39.89 
 
 
556 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.53 
 
 
601 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.63 
 
 
578 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  37.05 
 
 
586 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  37.57 
 
 
598 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  36.27 
 
 
650 aa  378  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  39.07 
 
 
586 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  36.46 
 
 
589 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  36.76 
 
 
582 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.85 
 
 
614 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  37.91 
 
 
601 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  36.09 
 
 
606 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  37.96 
 
 
660 aa  366  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  35.1 
 
 
591 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  41.34 
 
 
588 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  37.31 
 
 
597 aa  365  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.88 
 
 
582 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  36.33 
 
 
597 aa  364  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
598 aa  364  3e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  36.1 
 
 
617 aa  363  6e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  36.4 
 
 
575 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  35.24 
 
 
601 aa  362  8e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  36.28 
 
 
617 aa  362  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  35.35 
 
 
601 aa  362  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36 
 
 
602 aa  361  2e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  35.35 
 
 
601 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  36.14 
 
 
580 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.25 
 
 
608 aa  360  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
620 aa  359  6e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  36.36 
 
 
602 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  35.85 
 
 
603 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35 
 
 
572 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  39.59 
 
 
575 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.54 
 
 
580 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  34.42 
 
 
595 aa  357  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  35.48 
 
 
613 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  35.26 
 
 
597 aa  355  8.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.47 
 
 
577 aa  355  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  34.68 
 
 
584 aa  355  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  36.82 
 
 
628 aa  355  2e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  33.74 
 
 
588 aa  352  8e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>