242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1577 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1577  LrgB family protein  100 
 
 		 230 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.4351e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  45.05 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1318  LrgB family protein  46.85 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95009e-21 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0212  LrgB family protein  43.06 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0412  LrgB family protein  41.03 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.579768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  41.55 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  37.44 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  37.22 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  40.91 
 
 		 237 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  41.06 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  37.09 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  37.91 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  36.94 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  38.46 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5706  hypothetical protein  36.32 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5281  hypothetical protein  36.32 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  36.32 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4924  LrgB family protein  36.32 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609983  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  34.72 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  38.94 
 
 		 246 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  38.21 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  35.85 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  35.85 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  35.85 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  35.85 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  35.85 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  39.18 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  36.16 
 
 		 244 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  36.16 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1100  putative inner membrane protein yohK  38.43 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  37.5 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  36.89 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  34.56 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  33.81 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2563  hypothetical protein  32.11 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2616  hypothetical protein  32.11 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  35.81 
 
 		 238 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1954  LrgB family protein  36.77 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  35.21 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  33.48 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0623  LrgB-like protein  36.11 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  35.81 
 
 		 238 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  36.82 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  36.82 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  36.44 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0666  LrgB family protein  37.5 
 
 		 238 aa  128  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4980  LrgB-like protein  37.33 
 
 		 238 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  35.35 
 
 		 238 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0546  LrgB family protein  41.71 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3524  LrgB family protein  32.72 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0492  LrgB-like protein  39.78 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  35.86 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  32.72 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  35.71 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1359  LrgB family protein  31.53 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5246  hypothetical protein  36.84 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3855  hypothetical protein  32.72 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  35.24 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  38.43 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3388  LrgB family protein  34.98 
 
 		 238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0156  LrgB family protein  38.81 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  36.84 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3598  hypothetical protein  35.19 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.350738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3884  hypothetical protein  35.19 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  36.49 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  34.67 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3765  hypothetical protein  35.19 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000370937 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  37.96 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  35.71 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2209  LrgB family protein  35.75 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  0.130625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0333  LrgB-like protein  37.24 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3283  LrgB family protein  40.11 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.381562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1853  LrgB family protein  35.78 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0811  putative effector of murein hydrolase  33.33 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00607912  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  36.97 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  36.97 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  37.08 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1444  hypothetical protein  32.26 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000188634 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  34.22 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  35.75 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0089  LrgB family protein  34.5 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0099  LrgB family protein  34.5 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  36.76 
 
 		 231 aa  121  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1148  hypothetical protein  36.82 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000875943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  35.38 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  36.49 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  35.35 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  31.36 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  36.27 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  36.27 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2670  hypothetical protein  37.61 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  36.27 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  36.27 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  36.27 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  36.27 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  34.74 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1482  putative effector of murein hydrolase  34.42 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0187991  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  33.79 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  36.27 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0082  LrgB-like protein  35 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>