More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5427 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  100 
 
 		 432 aa  887    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  42.79 
 
 		 440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  33.96 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  31.8 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  32.64 
 
 		 440 aa  176  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  29.93 
 
 		 424 aa  166  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  31.87 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.71 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  30.75 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  29.48 
 
 		 437 aa  159  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  30.71 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  30.98 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  29.72 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  31.45 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  30.66 
 
 		 445 aa  155  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  31.71 
 
 		 423 aa  155  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.25 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  29.28 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  33.41 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.74 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  30.9 
 
 		 408 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  30.9 
 
 		 408 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  30.9 
 
 		 408 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  28.23 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  30.6 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  29.47 
 
 		 414 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.25 
 
 		 426 aa  149  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  28.29 
 
 		 470 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  28.4 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  28.4 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  28.4 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  29.67 
 
 		 433 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  29.85 
 
 		 402 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  29.34 
 
 		 402 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  30.49 
 
 		 459 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  30.6 
 
 		 407 aa  143  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  27.16 
 
 		 409 aa  143  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  31.74 
 
 		 423 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  30.07 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  29.98 
 
 		 480 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  29.85 
 
 		 413 aa  139  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  29.98 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  31.15 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  30.27 
 
 		 432 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  29.22 
 
 		 411 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  29.19 
 
 		 428 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  28.93 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  31.19 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  30.17 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  28.27 
 
 		 431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  28.24 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  28.82 
 
 		 396 aa  133  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  29.58 
 
 		 445 aa  133  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  30.55 
 
 		 428 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  30.43 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  29.86 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  28.8 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  30.29 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  29.03 
 
 		 419 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  29.71 
 
 		 455 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  31.1 
 
 		 441 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  29.64 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  29.51 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  29.71 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  28.16 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  29.27 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  29.53 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  28.25 
 
 		 390 aa  126  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  28.78 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  28.17 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  28.27 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  28.78 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  28.5 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  27.63 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  30.12 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  27.75 
 
 		 401 aa  123  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  29.97 
 
 		 433 aa  123  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  26.75 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  28.07 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  27.59 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  27.75 
 
 		 412 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  28.5 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  28.29 
 
 		 413 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  27.97 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  27.7 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  27.8 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  28.6 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  28.29 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  31.3 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  28.29 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  29.25 
 
 		 447 aa  118  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  28.71 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  27.03 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  28.54 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  27.76 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  28.07 
 
 		 416 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  28.39 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  26.33 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0275  amidohydrolase  28.35 
 
 		 413 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  27.76 
 
 		 417 aa  113  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>