More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2784 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  100 
 
 		 127 aa  265  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  70.41 
 
 		 98 aa  150  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  68.75 
 
 		 98 aa  144  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  56.12 
 
 		 98 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01370  thioredoxin C-2  48.98 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.602659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1624  thioredoxin domain-containing protein  47.92 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  47.87 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  56.18 
 
 		 105 aa  104  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  52.63 
 
 		 101 aa  103  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  53.93 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  44.68 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  47.25 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  46.24 
 
 		 108 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  46.24 
 
 		 108 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  46.24 
 
 		 108 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  46.24 
 
 		 108 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  46.24 
 
 		 108 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  46.24 
 
 		 108 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  46.24 
 
 		 108 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  44.9 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  44.9 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  45.16 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  47.96 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  44.9 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  44.9 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  44.9 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  52.04 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  52.04 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  45.92 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  45.92 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  44.9 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  45.16 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  45.83 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  45.92 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  46.94 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  46.81 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  45.92 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  47.87 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  56.94 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  50 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  42.86 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  45.36 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  47.42 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  43.62 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  43.62 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  50.63 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  41.49 
 
 		 120 aa  94.4  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  45.74 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  45.74 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  45.74 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  51.28 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  48.28 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  46.81 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  46.43 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  37.7 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  41.57 
 
 		 229 aa  91.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  45.05 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  44.68 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  44.68 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  44.68 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  44.68 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  44.68 
 
 		 108 aa  91.3  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  42.55 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  50 
 
 		 112 aa  90.9  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  46.67 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  41.49 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  41.57 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  41.49 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  41.84 
 
 		 108 aa  90.5  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  45.05 
 
 		 108 aa  90.5  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  44.33 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  41.49 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  43.82 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  40.43 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  43.62 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  43.82 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  43.62 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  43.62 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  43.96 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  48.72 
 
 		 106 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  43.62 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  51.39 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  47.3 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  50.7 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  40.2 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  37.29 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  40.43 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  40.66 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  45.05 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  45.57 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  41.94 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  41.94 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  48.28 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  42.55 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  41.94 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  46.15 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>