More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1191 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1191  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 
489 aa  1009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419241  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0559  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.11 
 
 
508 aa  535  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.82 
 
 
493 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.1 
 
 
494 aa  425  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3547  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.8 
 
 
477 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224357  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4623  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.34 
 
 
489 aa  356  6e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609617  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
478 aa  328  1e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7471  GntR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
449 aa  327  2e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
470 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 
470 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  39.63 
 
 
480 aa  322  1e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
521 aa  319  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
492 aa  316  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.88 
 
 
487 aa  314  2e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
470 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.39 
 
 
482 aa  308  1e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2755  putative transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 
456 aa  293  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.243959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2235  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.88 
 
 
473 aa  293  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.1 
 
 
472 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4822  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
496 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2912  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 
485 aa  276  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.784119  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1025  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 
499 aa  275  1e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.684124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2642  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
496 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2148  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
498 aa  267  3e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4437  GntR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
469 aa  255  1e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3187  transcriptional regulator  34.12 
 
 
487 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.685376  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
503 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  31.98 
 
 
484 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
490 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
496 aa  220  4e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
509 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  7.22465e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
509 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  30.94 
 
 
503 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
504 aa  210  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  31.27 
 
 
517 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  6.15538e-06  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
502 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
502 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  32.06 
 
 
502 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
503 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  32.26 
 
 
508 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  2.08159e-08  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  31.4 
 
 
509 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
490 aa  206  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  33.19 
 
 
493 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  29.81 
 
 
509 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
501 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  30.82 
 
 
502 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  29.83 
 
 
498 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
475 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
494 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.67 
 
 
517 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
494 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
502 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  31.44 
 
 
495 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  30.52 
 
 
494 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
494 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
494 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  32.13 
 
 
476 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  30.02 
 
 
520 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  31.48 
 
 
504 aa  201  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.72 
 
 
477 aa  199  8e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.29089e-09 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.22 
 
 
472 aa  199  1e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
480 aa  197  2e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
477 aa  198  2e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
477 aa  198  2e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
547 aa  198  2e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
477 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  29.51 
 
 
477 aa  197  4e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  33.1 
 
 
493 aa  197  4e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.3 
 
 
477 aa  197  5e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  33.1 
 
 
570 aa  196  5e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  29.11 
 
 
480 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4617  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
480 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.11 
 
 
483 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.65 
 
 
499 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
475 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  29.46 
 
 
520 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  1.52055e-05  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
488 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  29.92 
 
 
523 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.09 
 
 
488 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 
480 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.08 
 
 
480 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.08 
 
 
480 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  32.86 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
480 aa  193  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
480 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.94 
 
 
477 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  2.01635e-06 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
480 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.72 
 
 
477 aa  193  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 
480 aa  193  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  4.75852e-14 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
562 aa  193  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.79 
 
 
485 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.02 
 
 
499 aa  192  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  31.99 
 
 
508 aa  192  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.5 
 
 
488 aa  192  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
564 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  31.4 
 
 
561 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
564 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
546 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
477 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
480 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>