More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0314 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
348 aa  723    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  44.19 
 
 
311 aa  260  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 
303 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  41.43 
 
 
313 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  43 
 
 
321 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  36.61 
 
 
334 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  38.5 
 
 
334 aa  142  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 
325 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 
306 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
324 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  36.7 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
350 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  30.88 
 
 
332 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  28.34 
 
 
339 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.73 
 
 
241 aa  106  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
1171 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  34.95 
 
 
325 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.99 
 
 
326 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.59 
 
 
331 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.81 
 
 
326 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.81 
 
 
326 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
367 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
234 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
247 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
307 aa  99.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  41.75 
 
 
235 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  31.16 
 
 
326 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  31.56 
 
 
357 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  45.63 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.08 
 
 
326 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  46.6 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 
331 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.99 
 
 
294 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2566  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
252 aa  93.2  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  30.73 
 
 
308 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
280 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  28.44 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  39.53 
 
 
334 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  30.99 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  29.28 
 
 
237 aa  90.5  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
390 aa  90.5  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  40 
 
 
254 aa  90.1  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11550  sugar transferase  33.18 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  38.58 
 
 
373 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.69 
 
 
341 aa  89.7  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.89 
 
 
313 aa  89.4  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
290 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  38.58 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  39.68 
 
 
380 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
341 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
256 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
365 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  29.87 
 
 
313 aa  87.8  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 
663 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
277 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
374 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.17 
 
 
367 aa  87  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  35.88 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 
581 aa  87  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
319 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
398 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  29.94 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  37.84 
 
 
672 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3357  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  35.07 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 
249 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
283 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  27.08 
 
 
708 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  43.52 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.09 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  45.16 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  37.96 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  40.78 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6556  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 
336 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.998721  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>