135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1002 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  100 
 
 		 240 aa  490  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  56.14 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  52.54 
 
 		 240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  36.86 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  32.26 
 
 		 244 aa  111  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  30.32 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  29.52 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  30.05 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  31.28 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  25.37 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  29.55 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  32.06 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  27.71 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  37.4 
 
 		 200 aa  62  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  27.33 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  23.53 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  27.49 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  29.32 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  31.47 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  25.47 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  27.91 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  30.47 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  29.45 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  30.4 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  31.2 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  31.2 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  28.85 
 
 		 566 aa  53.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  31.2 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  31.2 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  33.33 
 
 		 378 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  28.31 
 
 		 338 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  30.19 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.85 
 
 		 315 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  33.33 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  30.19 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  26.62 
 
 		 307 aa  48.9  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  42.42 
 
 		 414 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  32.76 
 
 		 381 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  24.71 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  33.61 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45331  predicted protein  35.29 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  26.54 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  36.23 
 
 		 409 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.89 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  30.7 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  28.91 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  30.33 
 
 		 374 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  31.61 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  31.03 
 
 		 368 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  31.15 
 
 		 358 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  28.65 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  31.15 
 
 		 389 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  27.95 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0650  hypothetical protein  37.93 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.348415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.67 
 
 		 324 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2067  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.83 
 
 		 286 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  39.44 
 
 		 345 aa  45.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  29.51 
 
 		 374 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  31.25 
 
 		 386 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.04 
 
 		 295 aa  45.4  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0129  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.62 
 
 		 403 aa  45.4  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.483434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.72 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  32.79 
 
 		 425 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  30.47 
 
 		 382 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1170  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.86 
 
 		 418 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.513218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1241  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.63 
 
 		 418 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101333  normal  0.895253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1171  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.86 
 
 		 418 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1003  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.09 
 
 		 413 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  39.39 
 
 		 390 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  32.79 
 
 		 378 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.31 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16816  predicted protein  25.15 
 
 		 669 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000655212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  39.39 
 
 		 390 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.45 
 
 		 300 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  32.79 
 
 		 378 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.8 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  36.76 
 
 		 379 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2360  putative ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.998553  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  28.45 
 
 		 388 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  32.79 
 
 		 378 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  32.79 
 
 		 396 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.8 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  32.79 
 
 		 378 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  32.79 
 
 		 378 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.8 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.46 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.8 
 
 		 300 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  31.97 
 
 		 378 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.45 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.8 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.8 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.8 
 
 		 300 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.8 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  36.11 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>