87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0159 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  100 
 
 
113 aa  219  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  56.64 
 
 
113 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  54.72 
 
 
115 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  48.62 
 
 
133 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  40.19 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  39.25 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  39.25 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  39.25 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  39.8 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  34.34 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  37.11 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  34.65 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  34.65 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3137  hypothetical protein  42.35 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  33.67 
 
 
138 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  32.99 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  34.02 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  29.9 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  29.59 
 
 
203 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  35.42 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2060  protein of unknown function DUF583  30.09 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  27.96 
 
 
187 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  33 
 
 
195 aa  55.5  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  30.1 
 
 
184 aa  54.7  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  31.96 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  34.02 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  31.96 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  32.22 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  32.98 
 
 
195 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  31.96 
 
 
143 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  30.56 
 
 
134 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  31.65 
 
 
224 aa  50.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  25 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  35.06 
 
 
247 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  31.48 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  29 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  28.28 
 
 
262 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  32.98 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  31.48 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  28.28 
 
 
262 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0236  hypothetical protein  30.3 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00758504  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  29.35 
 
 
282 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  27.84 
 
 
196 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  29.35 
 
 
265 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  26.8 
 
 
125 aa  47.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  32.99 
 
 
278 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  28.57 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  29.9 
 
 
173 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  30.61 
 
 
123 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  26.92 
 
 
152 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  31.4 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  29.9 
 
 
269 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1888  hypothetical protein  27.84 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000131762  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  28.3 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0548  hypothetical protein  25.51 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0350066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  29.9 
 
 
270 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  29.9 
 
 
267 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  31.4 
 
 
131 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  26.04 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  30.77 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  30.28 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  28.3 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  25.93 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1707  hypothetical protein  28.43 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.195534  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  28.57 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  27.08 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  27.84 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  29.41 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  28.74 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  25.81 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  26.47 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  31.18 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  30.21 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  27.17 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  24.73 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  25 
 
 
141 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  25.77 
 
 
148 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  27.17 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  26.04 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  28.26 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  26.04 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  30.53 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  28.26 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  26.61 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  25 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  25 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  25 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>