More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3630 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  100 
 
 		 146 aa  293  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  72.93 
 
 		 139 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  71.43 
 
 		 139 aa  193  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  63.19 
 
 		 152 aa  184  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  64.29 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.65 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.33 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.04 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.52 
 
 		 139 aa  127  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  48.57 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.01 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  46.88 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  46.09 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  46.04 
 
 		 140 aa  116  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  45.99 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  43.75 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  43.15 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.14 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  46.72 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  42.11 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  40.16 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  41.48 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  40.16 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  41.94 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  46.21 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0205  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.62 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  40.14 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  40.14 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  41.54 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  46.72 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.72 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.72 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.26 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.4 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.9 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  44.26 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  44.26 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  43.61 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  43.44 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.55 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4541  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.83 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  47.06 
 
 		 155 aa  98.6  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  40.31 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  40.16 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.6 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.44 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.44 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  40.31 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  37.76 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  40 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  40 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.46 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.35 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.29 
 
 		 173 aa  98.2  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  41.43 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.54 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  38.51 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  38.51 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  42.76 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.51 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  43.08 
 
 		 177 aa  97.1  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.52 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.84 
 
 		 154 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  39.67 
 
 		 146 aa  96.7  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  42.28 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.02 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1242  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.46 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0853044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.85 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  41.8 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  45 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.31 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.94 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  39.37 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3640  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.91 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.46 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.31 
 
 		 137 aa  94.7  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.62 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  45 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3325  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.31 
 
 		 137 aa  94.7  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110206  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  39.67 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  39.42 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.41 
 
 		 166 aa  94  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  45 
 
 		 141 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  42.19 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.32 
 
 		 149 aa  94  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  40 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  41.41 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  41.41 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.78 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  36.99 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0374  TonB system transport protein ExbD type-1  43.65 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0825  TonB system transport protein ExbD  44.92 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.027584 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.41 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.78 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.78 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>