174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3521 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  249  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 123 aa  143  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  43.01 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  42.48 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  37.96 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  39.39 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  35.96 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  36.21 
 
 		 245 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  37.04 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  34.58 
 
 		 247 aa  73.6  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  41.12 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  36.63 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  36.11 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  36.79 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  35.51 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  35.51 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  35.51 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  38.32 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  41.86 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  33.71 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  34.65 
 
 		 263 aa  57.4  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2967  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  42.17 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  34.95 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  37.78 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1450  molybdenum-binding protein  33 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  35 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2849  regulatory protein LysR  41.18 
 
 		 345 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3075  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  40 
 
 		 346 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  31.48 
 
 		 257 aa  53.9  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3020  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  41.86 
 
 		 359 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475131  normal  0.0124041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0967  molybdate metabolism transcriptional regulator  43.53 
 
 		 359 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.67 
 
 		 368 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.67 
 
 		 368 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.67 
 
 		 368 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  52.27 
 
 		 267 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  39.73 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  30.53 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0932  regulatory protein, LysR  40.23 
 
 		 365 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658319  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 258 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1694  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 309 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.726812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  47.17 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4147  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.67 
 
 		 368 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.70321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2477  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  33.85 
 
 		 373 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.497113  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  31.68 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  32.14 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0730  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.56 
 
 		 360 aa  48.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.739883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  40.48 
 
 		 366 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3130  molybdate metabolism transcriptional regulator  32.31 
 
 		 373 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 261 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0910  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.48 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527444  normal  0.0178578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0898  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.48 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  33.66 
 
 		 268 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  30.49 
 
 		 260 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  37.88 
 
 		 263 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  37.88 
 
 		 263 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1919  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  39.08 
 
 		 366 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360263  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2363  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.48 
 
 		 368 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  38.1 
 
 		 366 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  33.66 
 
 		 264 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2224  molybdate metabolism transcriptional regulator  33.71 
 
 		 375 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 290 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 278 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  34.52 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  32.39 
 
 		 262 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 262 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1147  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 303 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.451163  normal  0.239422 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  34.52 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  35 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4399  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 306 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.937642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 268 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  35.24 
 
 		 270 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  35.24 
 
 		 270 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1625  molybdate transport repressor  41.03 
 
 		 368 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>