More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1583 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  100 
 
 
279 aa  577  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  70.65 
 
 
279 aa  431  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  70.96 
 
 
280 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  61.68 
 
 
274 aa  357  9e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  40.08 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  38.38 
 
 
280 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  37.32 
 
 
284 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  38.7 
 
 
284 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  36.36 
 
 
284 aa  195  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  34.22 
 
 
280 aa  166  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  34.9 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 
407 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  31.37 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  30.83 
 
 
289 aa  145  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 
297 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  30.68 
 
 
297 aa  142  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  32.96 
 
 
352 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
286 aa  138  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  29.35 
 
 
298 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  31.12 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  29.46 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  29.79 
 
 
291 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 
289 aa  132  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  31.09 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  31.2 
 
 
455 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 
353 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  32.19 
 
 
299 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  29.36 
 
 
291 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  31.06 
 
 
351 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  33.21 
 
 
378 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  34.72 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  31.9 
 
 
284 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 
297 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
284 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
408 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.74 
 
 
280 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  29.73 
 
 
297 aa  122  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  31.1 
 
 
283 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  32.23 
 
 
283 aa  122  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 
412 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  27.43 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  30.74 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 
285 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 
425 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 
292 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  29.93 
 
 
373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  28.32 
 
 
280 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  31.94 
 
 
292 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  27.23 
 
 
305 aa  115  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  28.62 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  29.61 
 
 
369 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  32.51 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 
397 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  34.25 
 
 
274 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 
280 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  27.39 
 
 
274 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 
297 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  27.39 
 
 
274 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  27.39 
 
 
274 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  30.42 
 
 
358 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  29.91 
 
 
275 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 
340 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  29.91 
 
 
275 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  34.72 
 
 
275 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  28.14 
 
 
299 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  27.83 
 
 
313 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  28.02 
 
 
274 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  29.63 
 
 
288 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  27.16 
 
 
277 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  30.59 
 
 
290 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  30.56 
 
 
290 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  27.44 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  25.41 
 
 
288 aa  99.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  26.17 
 
 
275 aa  99.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  29.44 
 
 
302 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  29.85 
 
 
716 aa  98.6  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  30.09 
 
 
290 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  29.6 
 
 
730 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  26.2 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  28 
 
 
292 aa  96.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  29.8 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  28.64 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  24.34 
 
 
517 aa  95.9  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  23.31 
 
 
290 aa  95.9  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  27.49 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  27.49 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  26.27 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  27.49 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 
427 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  27.49 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>