54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0659 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0711  extracellular solute-binding protein family 1  92.18 
 
 		 436 aa  853    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0659  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 435 aa  910    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3526  extracellular solute-binding protein family 1  84.53 
 
 		 435 aa  776    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.077506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3675  extracellular solute-binding protein family 1  85.22 
 
 		 435 aa  783    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616273  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5076  extracellular solute-binding protein family 1  45.5 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340965  normal  0.383073 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5356  extracellular solute-binding protein family 1  46.23 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0798754  normal  0.176605 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5755  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  45.48 
 
 		 425 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428536  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1699  extracellular solute-binding protein family 1  32.05 
 
 		 419 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1885  extracellular solute-binding protein family 1  31.81 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3944  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 422 aa  140  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.282645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3075  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0067  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  21.86 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 457 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  22.3 
 
 		 504 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 429 aa  53.1  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1679  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000895921  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.99 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  20.63 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  22.94 
 
 		 440 aa  47.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2545  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 442 aa  46.6  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4693  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.363745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0090  extracellular solute-binding protein family 1  22.18 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1702  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  22 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  20.11 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.29 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  21.32 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  24.6 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1748  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 481 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 493 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  21.48 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3027  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 467 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 414 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>