111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3191 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
161 aa  331  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.74 
 
 
162 aa  112  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  32.85 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  39.16 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.06 
 
 
164 aa  84.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  32.69 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  31.06 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  29.38 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  30.13 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  34.81 
 
 
178 aa  73.9  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.82 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  32.93 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.9 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.29 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.58 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  31.61 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  31.61 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.77 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.56 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  31.34 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  32.58 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.51 
 
 
175 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  30.52 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.21 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.09 
 
 
210 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.33 
 
 
172 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  29.46 
 
 
182 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.3 
 
 
168 aa  60.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.12 
 
 
179 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  29.08 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  29.08 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  29.09 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  29.08 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  28.67 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  28.37 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  29.08 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  29.09 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  27.1 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  30.99 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.04 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.79 
 
 
178 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.2 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.75 
 
 
170 aa  58.9  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  28.21 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.34 
 
 
167 aa  58.5  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  30.6 
 
 
172 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  27.88 
 
 
167 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  30.6 
 
 
172 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  30.6 
 
 
172 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.12 
 
 
165 aa  57.4  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.09 
 
 
163 aa  57.4  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.37 
 
 
170 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  31.76 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  28.37 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  29.09 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.32 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  26.67 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.45 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  29.17 
 
 
177 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  34.31 
 
 
160 aa  54.3  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.94 
 
 
162 aa  54.3  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  28.26 
 
 
161 aa  53.9  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  31.69 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  27.13 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.65 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  30.61 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  31.71 
 
 
148 aa  52  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.91 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  29.63 
 
 
157 aa  50.8  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.56 
 
 
186 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.48 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  30 
 
 
169 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.93 
 
 
154 aa  48.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  29.79 
 
 
173 aa  48.1  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  29.85 
 
 
180 aa  48.1  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  33.33 
 
 
173 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  32.12 
 
 
174 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  26.67 
 
 
155 aa  47.4  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.01 
 
 
162 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  26.47 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  31.1 
 
 
158 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  26.47 
 
 
171 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  28.17 
 
 
164 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  31.1 
 
 
158 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.39 
 
 
157 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  30 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  30 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.29 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  26.04 
 
 
171 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1112  phosphodiesterase  32.24 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.279035  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  30.46 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.16 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.48 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.17 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  30.15 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  27.08 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0879  diadenosine tetraphosphatase-like protein  27.37 
 
 
284 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.237996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  25.61 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3372  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.93 
 
 
234 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>