262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2433 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  45.25 
 
 		 265 aa  202  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  48.47 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  47.95 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  37.76 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  36.49 
 
 		 284 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  36.15 
 
 		 225 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  37.1 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  35.68 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  35.68 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  33.98 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  33.99 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  37.25 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  33.5 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  43.54 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  40.7 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  33.68 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  34.85 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  42.18 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  31.63 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  32.72 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  34.17 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  36.5 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  33.84 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  35.35 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  37.18 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  35.29 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  33.71 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  34.1 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  38.12 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  33.15 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  31.46 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  32.5 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  34.17 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  32.5 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  36.13 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  30.77 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  30.57 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  36.59 
 
 		 228 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  33.16 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  35.09 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  33.68 
 
 		 226 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  29.8 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  35.26 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  33.68 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  36.36 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  56.47 
 
 		 140 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  36.36 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  35.71 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  29.59 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  32.21 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  31.19 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  52.87 
 
 		 131 aa  92  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  35.06 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  28.8 
 
 		 227 aa  91.7  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  30.23 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  30.81 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  57.69 
 
 		 134 aa  91.3  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  29.38 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  29.38 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  29.84 
 
 		 278 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  28.87 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  28.87 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  28.27 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  27.69 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  34.15 
 
 		 226 aa  88.2  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  29.69 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  32.47 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  29.69 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  31.68 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  32.47 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  32.47 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  32.47 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  32.47 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  28.43 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  29.84 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  30 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  29.84 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  30 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  29.58 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  28.57 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  27.6 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  28.95 
 
 		 277 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  28.95 
 
 		 277 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  31.94 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  31.68 
 
 		 245 aa  85.5  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  28.95 
 
 		 277 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  28.95 
 
 		 277 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  28.87 
 
 		 280 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  28.35 
 
 		 280 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  52.7 
 
 		 142 aa  85.1  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  28.35 
 
 		 280 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  28.73 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  28.71 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>