More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0001 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 		 449 aa  934    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2320  DnaA family protein  50.66 
 
 		 461 aa  482  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0326594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.34 
 
 		 498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184051 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0785  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.7 
 
 		 460 aa  448  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0991  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.89 
 
 		 504 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00365365  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0833  Chromosomal replication initiator DnaA  42.56 
 
 		 482 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.093159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.65 
 
 		 450 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.04 
 
 		 460 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  33.64 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  33.64 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  34.75 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.75 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  34.75 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  34.75 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  34.75 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  34.75 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  34.75 
 
 		 467 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  34.75 
 
 		 467 aa  243  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  33.72 
 
 		 450 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  33.86 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.26 
 
 		 462 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  34.53 
 
 		 467 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.98 
 
 		 483 aa  240  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  34.16 
 
 		 466 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  34.16 
 
 		 466 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  34.16 
 
 		 466 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  34.16 
 
 		 466 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  34.16 
 
 		 466 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  31.97 
 
 		 461 aa  239  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  32.28 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  32.28 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  32.28 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  32.66 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  32.28 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  32.88 
 
 		 465 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.26 
 
 		 464 aa  237  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  31.97 
 
 		 461 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  32.28 
 
 		 460 aa  236  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  32.05 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  32.66 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  32.05 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  33.87 
 
 		 455 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  32.43 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  31.67 
 
 		 462 aa  233  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  31.24 
 
 		 452 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  33.84 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.59 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3714  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.45 
 
 		 458 aa  230  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0883513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  32.05 
 
 		 459 aa  229  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.41 
 
 		 442 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  31.69 
 
 		 462 aa  229  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  29.78 
 
 		 446 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  30.86 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  31.51 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  32.87 
 
 		 468 aa  227  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  32.18 
 
 		 468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.35 
 
 		 498 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  31.25 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  31.54 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  30.63 
 
 		 482 aa  224  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.8 
 
 		 461 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  29.94 
 
 		 464 aa  223  7e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  29.89 
 
 		 481 aa  223  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  30.72 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  30.72 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.9 
 
 		 469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  32.39 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  32.39 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  31.05 
 
 		 452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  29.8 
 
 		 446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.44 
 
 		 444 aa  220  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  30.46 
 
 		 450 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  30.46 
 
 		 463 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  31.42 
 
 		 452 aa  219  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  31.42 
 
 		 452 aa  219  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  30.51 
 
 		 459 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  31.74 
 
 		 450 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  30.8 
 
 		 453 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  28.66 
 
 		 480 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.69 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  28.94 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  29.14 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  31.36 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  28.99 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.16 
 
 		 476 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  28.82 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  29.23 
 
 		 454 aa  216  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  30.49 
 
 		 494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  28.96 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08301  chromosomal replication initiation protein  31.82 
 
 		 463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>