More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2137 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2137  putative cysteine desulfurase  100 
 
 
215 aa  440  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.26763e-17  decreased coverage  0.000090972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  83.33 
 
 
666 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  83.33 
 
 
650 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  81.46 
 
 
682 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  83.33 
 
 
666 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  81.46 
 
 
688 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  81.92 
 
 
630 aa  306  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  81.56 
 
 
608 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  81.71 
 
 
661 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  81.36 
 
 
679 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  77.22 
 
 
605 aa  294  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  82.18 
 
 
671 aa  292  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  82.18 
 
 
685 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  82.18 
 
 
660 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  82.18 
 
 
660 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  82.18 
 
 
660 aa  291  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  82.18 
 
 
660 aa  291  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  82.18 
 
 
660 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  78.53 
 
 
604 aa  291  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  78.53 
 
 
604 aa  291  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  77.53 
 
 
641 aa  290  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  75.98 
 
 
941 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  72.78 
 
 
621 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  71.98 
 
 
665 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  70.06 
 
 
774 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  69.44 
 
 
626 aa  267  8e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.95 
 
 
678 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.03 
 
 
662 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  69.35 
 
 
610 aa  261  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  65.56 
 
 
560 aa  260  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  66.3 
 
 
657 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  69.32 
 
 
629 aa  259  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.05 
 
 
644 aa  256  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.23 
 
 
444 aa  228  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.01 
 
 
674 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.01 
 
 
672 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.57 
 
 
664 aa  223  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.45 
 
 
673 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  55.62 
 
 
420 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.56 
 
 
451 aa  208  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50 
 
 
408 aa  207  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  53.11 
 
 
419 aa  206  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.67 
 
 
404 aa  204  9e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.33 
 
 
412 aa  202  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56 
 
 
418 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.86 
 
 
416 aa  198  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  46.19 
 
 
405 aa  194  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  46.19 
 
 
405 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.74 
 
 
404 aa  193  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46 
 
 
404 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  51.45 
 
 
414 aa  188  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.3 
 
 
413 aa  188  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.12 
 
 
419 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  56 
 
 
419 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  49.71 
 
 
425 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.69 
 
 
429 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  49.44 
 
 
412 aa  185  4e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.1 
 
 
429 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.69 
 
 
429 aa  184  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  48.02 
 
 
412 aa  182  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.22 
 
 
417 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.29 
 
 
425 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 
416 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.72 
 
 
415 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  50 
 
 
416 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.73 
 
 
429 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  47.98 
 
 
422 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.64 
 
 
427 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  49.43 
 
 
414 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.93 
 
 
415 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  49.72 
 
 
413 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.6 
 
 
421 aa  174  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.19 
 
 
418 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 
414 aa  172  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  47.4 
 
 
404 aa  172  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  44.57 
 
 
405 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  47.19 
 
 
408 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  45.51 
 
 
496 aa  172  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.78 
 
 
416 aa  171  5.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  48.04 
 
 
406 aa  170  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.04 
 
 
406 aa  170  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.04 
 
 
406 aa  170  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.04 
 
 
406 aa  170  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  48.04 
 
 
406 aa  170  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.04 
 
 
406 aa  170  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.93 
 
 
406 aa  171  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.76 
 
 
425 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.4 
 
 
413 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  47.75 
 
 
417 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.04 
 
 
406 aa  169  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.57 
 
 
418 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.82 
 
 
414 aa  169  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  45 
 
 
414 aa  169  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.9 
 
 
417 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.04 
 
 
406 aa  168  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.49 
 
 
406 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.49 
 
 
406 aa  168  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.44 
 
 
411 aa  168  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.49 
 
 
406 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.49 
 
 
406 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>