More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2112 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  100 
 
 
260 aa  531  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  61.15 
 
 
493 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  60 
 
 
479 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  61.35 
 
 
251 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  59.85 
 
 
444 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  59.46 
 
 
396 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  59.46 
 
 
396 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  59.46 
 
 
396 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  59.07 
 
 
427 aa  331  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  59.07 
 
 
405 aa  330  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  59.07 
 
 
399 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  59.07 
 
 
442 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  59.07 
 
 
444 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  59.07 
 
 
444 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  59.07 
 
 
444 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  59.07 
 
 
442 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  59.07 
 
 
442 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  59.07 
 
 
356 aa  327  8e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  59.6 
 
 
251 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  58.75 
 
 
258 aa  287  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  55.12 
 
 
266 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  51.75 
 
 
285 aa  259  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  52.16 
 
 
258 aa  254  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  48.44 
 
 
295 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  48.03 
 
 
307 aa  242  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  48.05 
 
 
313 aa  238  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  47.62 
 
 
272 aa  234  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  47.29 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  47.29 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0917  peptidase C26  45.83 
 
 
293 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  32.47 
 
 
238 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  43.16 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  43.18 
 
 
233 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  41.86 
 
 
235 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  41.36 
 
 
248 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  39.06 
 
 
238 aa  122  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  42.2 
 
 
240 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  42.2 
 
 
240 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  40.1 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  42.86 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  42.2 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  45.18 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  41.72 
 
 
250 aa  118  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  40.48 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  37.58 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  41.72 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1620  glutamine amidotransferase-like  38.69 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000108554  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  43.12 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  37.32 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  41.67 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  43.12 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  43.83 
 
 
252 aa  116  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  41.44 
 
 
222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  42.07 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  34.83 
 
 
241 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  46.3 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  41.07 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  41.61 
 
 
237 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  41.1 
 
 
259 aa  112  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  39.47 
 
 
312 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  43.71 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  40.12 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  40.7 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  38.73 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  43.12 
 
 
236 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  36.52 
 
 
229 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  33.89 
 
 
268 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  38.55 
 
 
251 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  38.65 
 
 
238 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  40.98 
 
 
237 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  36.41 
 
 
242 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  36.63 
 
 
264 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  39.76 
 
 
252 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
264 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  40.1 
 
 
272 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  35.65 
 
 
267 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  35.62 
 
 
267 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  38.24 
 
 
231 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  36.59 
 
 
273 aa  105  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  38.42 
 
 
259 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2749  peptidase C26  36.18 
 
 
262 aa  105  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  35.18 
 
 
238 aa  105  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  37.37 
 
 
247 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  39.7 
 
 
257 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3947  peptidase C26  37.29 
 
 
261 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505393  normal  0.911745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  37.95 
 
 
233 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  41.94 
 
 
250 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  36.57 
 
 
279 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  36.52 
 
 
242 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  39.7 
 
 
257 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  37.44 
 
 
273 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1111  peptidase C26  42.7 
 
 
246 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.517876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  37.97 
 
 
255 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  41.32 
 
 
280 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  34.08 
 
 
274 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  33.49 
 
 
313 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2941  glutamine amidotransferase related enzyme  35.88 
 
 
237 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  36.16 
 
 
268 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  38.18 
 
 
227 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  39.29 
 
 
253 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>