More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0035 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  789    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  52.59 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  47.3 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 425 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  42.07 
 
 		 418 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  40 
 
 		 420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 414 aa  233  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  39.59 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  38.96 
 
 		 420 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 		 413 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  38.69 
 
 		 413 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  39.46 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  40.1 
 
 		 412 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  40.1 
 
 		 412 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  40.1 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  40.1 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  40.1 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  40.1 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  40.1 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  36.73 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  41.46 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  38.93 
 
 		 493 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  38.56 
 
 		 420 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 415 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 410 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  42.47 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  39.69 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  32.49 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 407 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 418 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 434 aa  143  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  29.21 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 417 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 445 aa  133  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 418 aa  130  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 428 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 421 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 446 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 437 aa  106  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  30.05 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  29.56 
 
 		 422 aa  103  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  28.61 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  30.05 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  29.51 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 436 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  24.72 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  24.44 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  25.93 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  24.53 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  31.38 
 
 		 437 aa  90.1  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  22 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  31.38 
 
 		 437 aa  90.1  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  21.84 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  24.91 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  31.29 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  31.29 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3390  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 441 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 421 aa  87  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  23.12 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  28.37 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  24.74 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  26.19 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  22.38 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  25.56 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  32.31 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  28.92 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  27.45 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>