95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1495 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  564  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  99.63 
 
 		 273 aa  563  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  86.08 
 
 		 277 aa  487  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  30.84 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  30.21 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  32.29 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  27.24 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  32.59 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  30.11 
 
 		 270 aa  92  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  30.92 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.03 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  34.87 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  30.7 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  27.61 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  27.57 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  27.57 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  29.32 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  34.2 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  36.84 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  34.67 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  34.87 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.83 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  30.45 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  30.04 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  28.02 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  30.2 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  29.84 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  34.9 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  28.63 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  24.53 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  26.92 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  30.41 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  27.85 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  25 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  24.66 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  27.52 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.4 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  26.25 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  27.78 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  22.75 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  29.17 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  31.03 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  25.88 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  24.43 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.19 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  25.6 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  24.83 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  24.3 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  21.38 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  23.58 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  24.62 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  25.97 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 203 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  23.19 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  43.08 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  32.39 
 
 		 240 aa  49.7  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  25.31 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  22.52 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  32.59 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  23.51 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  41.82 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  22.27 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  32 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  52.63 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  31.4 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.26 
 
 		 352 aa  46.2  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  39.24 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.46 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  23.15 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.97 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.21 
 
 		 229 aa  43.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3003  protein of unknown function Met10  37.29 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  29.91 
 
 		 208 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  46.51 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2023  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.23 
 
 		 417 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.34 
 
 		 233 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.34 
 
 		 233 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  27.08 
 
 		 191 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  33.91 
 
 		 410 aa  42  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>