More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1308 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 275 aa  567  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  91.27 
 
 		 275 aa  521  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  89.82 
 
 		 275 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 		 282 aa  145  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 258 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  28.74 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1114  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0902731  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 502 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7352  Alpha/beta hydrolase  27.91 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  29.63 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  29.63 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  29.63 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  28.46 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  28.68 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.52 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 283 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  28.25 
 
 		 270 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 283 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28.36 
 
 		 268 aa  92  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.78 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  29.63 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  28.36 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  28.36 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 296 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  27.01 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4494  alpha/beta family hydrolase  29.62 
 
 		 270 aa  89  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 275 aa  89  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.82 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  27.44 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  27.44 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  27.84 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  27.31 
 
 		 275 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.45 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 278 aa  85.9  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 		 277 aa  86.3  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  26.84 
 
 		 277 aa  85.9  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 265 aa  85.9  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28 
 
 		 248 aa  85.5  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 		 281 aa  85.5  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  25.93 
 
 		 269 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.12 
 
 		 265 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  27.07 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  27.07 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.87 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  28.15 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  26.71 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28.25 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  29.54 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.08 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  25.56 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  30.38 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  26.84 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>