212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3272 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  100 
 
 
242 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  53.45 
 
 
243 aa  229  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  51.71 
 
 
245 aa  215  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  45.92 
 
 
241 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  51.54 
 
 
241 aa  208  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  48.93 
 
 
243 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.92 
 
 
254 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  51.25 
 
 
250 aa  204  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  56.47 
 
 
249 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  46.78 
 
 
238 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  46.12 
 
 
744 aa  198  6e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  49.54 
 
 
248 aa  198  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  43.78 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  50.64 
 
 
255 aa  195  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  48.75 
 
 
270 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.54 
 
 
248 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.59 
 
 
237 aa  191  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  42.19 
 
 
248 aa  191  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  47.06 
 
 
246 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.67 
 
 
251 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  42.67 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  42.67 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  42.08 
 
 
243 aa  178  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  45.09 
 
 
236 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.2 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.2 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  46.26 
 
 
238 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  40.15 
 
 
272 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  39.57 
 
 
261 aa  165  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.73 
 
 
262 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.56 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  41.25 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  38.86 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  44.3 
 
 
240 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  42.74 
 
 
240 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  38.25 
 
 
235 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  44.2 
 
 
239 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.08 
 
 
254 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  41.49 
 
 
240 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.14 
 
 
218 aa  153  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  37.86 
 
 
241 aa  152  7e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  36.71 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  36.71 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.73 
 
 
236 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.96 
 
 
245 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.41 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  39.17 
 
 
238 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  39.17 
 
 
238 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  39.17 
 
 
238 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  41.98 
 
 
247 aa  142  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  41.3 
 
 
235 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  38.99 
 
 
231 aa  142  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  37.93 
 
 
243 aa  142  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  37.61 
 
 
244 aa  142  5e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  40 
 
 
238 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.33 
 
 
237 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  39.06 
 
 
262 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  41.59 
 
 
272 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  39.73 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  40.17 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  41.36 
 
 
250 aa  135  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  33.94 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  41.59 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.81 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  26.87 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  41.94 
 
 
484 aa  65.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  33.49 
 
 
481 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3778  cobyric acid synthase  34.87 
 
 
488 aa  62  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  31.21 
 
 
465 aa  62  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  31.14 
 
 
501 aa  59.7  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  32.4 
 
 
490 aa  58.5  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  32.61 
 
 
488 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  33.7 
 
 
500 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  34.29 
 
 
500 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  33.14 
 
 
480 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  33.53 
 
 
484 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  30.24 
 
 
493 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  38.01 
 
 
490 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  34.12 
 
 
484 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2714  cobyric acid synthase  35.5 
 
 
500 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.199651  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  35.07 
 
 
503 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  27.27 
 
 
485 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  34.51 
 
 
858 aa  55.5  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  33.59 
 
 
494 aa  55.1  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  27.4 
 
 
772 aa  55.1  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  32.72 
 
 
490 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3285  cobyric acid synthase  37.18 
 
 
525 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  37.43 
 
 
490 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  30.99 
 
 
480 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4466  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.68 
 
 
430 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.360132  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  33.14 
 
 
489 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2197  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.59 
 
 
472 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.580658  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  33.54 
 
 
495 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2918  cobyric acid synthase  32.69 
 
 
525 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.182709 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  30.22 
 
 
492 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  30.37 
 
 
492 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  29.11 
 
 
512 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  34.07 
 
 
506 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  32.09 
 
 
503 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  34.29 
 
 
485 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>