More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0744 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  100 
 
 		 950 aa  1925    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  49.25 
 
 		 745 aa  241  6.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  38.59 
 
 		 897 aa  194  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0634  serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 		 695 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.171322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  38.71 
 
 		 535 aa  93.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  39.67 
 
 		 495 aa  91.7  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  37.88 
 
 		 483 aa  89.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  35.29 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  39.66 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  34.55 
 
 		 429 aa  84  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  41.38 
 
 		 478 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  31.52 
 
 		 383 aa  83.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  35.95 
 
 		 732 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  27.67 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  31.76 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  32.62 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  40 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  30 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  31.84 
 
 		 410 aa  80.9  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  30.23 
 
 		 401 aa  79.7  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1146  copper amine oxidase domain protein  24.51 
 
 		 371 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000389195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  26.46 
 
 		 410 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  34.48 
 
 		 763 aa  79.3  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  31.07 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  35.85 
 
 		 514 aa  77.8  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  37.96 
 
 		 216 aa  77.4  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  38.38 
 
 		 383 aa  77.4  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2516  carboxyl-terminal protease  29.24 
 
 		 1024 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  27.78 
 
 		 449 aa  76.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.75 
 
 		 907 aa  77  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  40.62 
 
 		 591 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 		 948 aa  77  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  35.29 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  35.9 
 
 		 259 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  30 
 
 		 526 aa  75.1  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  37.89 
 
 		 741 aa  75.1  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1994  C-terminal processing peptidase  30.9 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.72907  normal  0.0163388 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  23.71 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  30.68 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 		 418 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  27.62 
 
 		 439 aa  73.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  38.54 
 
 		 704 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  23.71 
 
 		 430 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  27.59 
 
 		 476 aa  73.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  39.8 
 
 		 320 aa  74.3  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  30.22 
 
 		 458 aa  73.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  34.1 
 
 		 397 aa  73.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  37.74 
 
 		 175 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  27.53 
 
 		 428 aa  73.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  27.15 
 
 		 515 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  43.53 
 
 		 480 aa  73.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 		 792 aa  73.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  34.26 
 
 		 625 aa  73.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  29.27 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  27.11 
 
 		 511 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  27.68 
 
 		 535 aa  73.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  26.01 
 
 		 515 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  26.01 
 
 		 515 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  29.51 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  28 
 
 		 515 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  26.01 
 
 		 515 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  37.5 
 
 		 781 aa  72.4  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  33.98 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  26.67 
 
 		 513 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  28.24 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  27.11 
 
 		 530 aa  72  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  28.14 
 
 		 482 aa  72  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  28.14 
 
 		 482 aa  72  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  27.6 
 
 		 427 aa  72  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  29.07 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  27.33 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  35.58 
 
 		 845 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  33.91 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  29.15 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  23.53 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  29.9 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  29.34 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  31.9 
 
 		 1176 aa  71.2  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  38.38 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  26.34 
 
 		 401 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  29.21 
 
 		 478 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  26.34 
 
 		 401 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  42.71 
 
 		 113 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  27.43 
 
 		 477 aa  70.9  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  32.9 
 
 		 544 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  26.34 
 
 		 401 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  27.47 
 
 		 439 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  26.34 
 
 		 401 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  30.36 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  30.39 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  28.04 
 
 		 458 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1858  copper amine oxidase domain protein  34.65 
 
 		 229 aa  69.7  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.164538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  29.09 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  28.04 
 
 		 458 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  24.76 
 
 		 446 aa  70.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  29.7 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  29.7 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  27.46 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  39.58 
 
 		 529 aa  69.7  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  27.57 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>