More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0634 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0634  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
695 aa  1429    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.171322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  29.61 
 
 
950 aa  124  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.89 
 
 
747 aa  114  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.36 
 
 
641 aa  110  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.22 
 
 
584 aa  110  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 
681 aa  107  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 
703 aa  107  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  34.34 
 
 
625 aa  107  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  34.34 
 
 
625 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  33.05 
 
 
604 aa  106  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 
624 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 
624 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.83 
 
 
700 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 
624 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.26 
 
 
696 aa  105  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.59 
 
 
647 aa  104  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.57 
 
 
1072 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.57 
 
 
1072 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  37.31 
 
 
625 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  31.36 
 
 
666 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  30 
 
 
1100 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.31 
 
 
645 aa  102  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.05 
 
 
627 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.01 
 
 
579 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  32.52 
 
 
668 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.36 
 
 
520 aa  101  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.88 
 
 
1076 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.9 
 
 
667 aa  101  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  33.5 
 
 
626 aa  101  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.44 
 
 
613 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.26 
 
 
650 aa  101  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1202  serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 
695 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0753061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  33.48 
 
 
646 aa  100  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 
650 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  29.64 
 
 
593 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  35.84 
 
 
612 aa  99.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 
651 aa  99.4  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  35.76 
 
 
609 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.33 
 
 
632 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.9 
 
 
517 aa  99  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5621  serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 
845 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205775  normal  0.427226 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_5526  predicted protein  31.82 
 
 
258 aa  98.6  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.55 
 
 
603 aa  98.2  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.95 
 
 
664 aa  98.6  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29 
 
 
681 aa  98.2  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  29.36 
 
 
638 aa  97.8  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
1289 aa  98.2  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 
691 aa  97.8  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.27 
 
 
850 aa  97.8  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40725  predicted protein  27.94 
 
 
293 aa  97.8  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.316803  normal  0.0251732 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  31.09 
 
 
692 aa  97.4  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  32.99 
 
 
692 aa  97.4  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  44.8 
 
 
719 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.78 
 
 
715 aa  96.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 
612 aa  96.3  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 
653 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 
657 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  34.83 
 
 
620 aa  96.3  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.33 
 
 
707 aa  95.9  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 
557 aa  95.9  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.73 
 
 
601 aa  95.5  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2434  Serine/threonine protein kinase-like  31.21 
 
 
896 aa  95.5  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0164734  normal  0.121518 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 
690 aa  95.9  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
657 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 
750 aa  95.1  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 
632 aa  95.1  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 
582 aa  94.7  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 
591 aa  94.4  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.04 
 
 
540 aa  94.7  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143916  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 
368 aa  94.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  30.84 
 
 
614 aa  94.4  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5416  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
583 aa  94.4  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.281665  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0279  serine/threonine protein kinase  28.8 
 
 
670 aa  94.4  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
657 aa  94.4  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
1415 aa  94.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.88 
 
 
740 aa  94.4  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  44.86 
 
 
770 aa  94.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  33.68 
 
 
1018 aa  94  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  25.51 
 
 
623 aa  94.4  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3747  serine/threonine protein kinase  35.12 
 
 
619 aa  94  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.350974  normal  0.548904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6773  serine/threonine protein kinase  41.43 
 
 
518 aa  94  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117813  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.29 
 
 
653 aa  94  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 
895 aa  94  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.76 
 
 
668 aa  94  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.56 
 
 
676 aa  93.6  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  32.59 
 
 
938 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  33.67 
 
 
439 aa  93.2  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  35.51 
 
 
667 aa  93.2  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.81 
 
 
863 aa  93.2  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
657 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
657 aa  92.8  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 
599 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
657 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  27.49 
 
 
565 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2716  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 
919 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  32.23 
 
 
344 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0689  kinase domain protein  25.98 
 
 
796 aa  92.8  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
657 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
580 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3485  serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 
754 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000103616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>