244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0388 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0388  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 289 aa  560  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  37.76 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1542  hypothetical protein  35.92 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.15 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0570975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  33.11 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0581  hypothetical protein  29.1 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.45 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.27 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  32.88 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  30.88 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  30.15 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  28.62 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  26.48 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  30.07 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  25.43 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  29.51 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  27.93 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  27.97 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.09 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  29.6 
 
 		 379 aa  79  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  28.67 
 
 		 335 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.57 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  28.08 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  28.41 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  27.74 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  28.24 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  27.88 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  24.32 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  27.27 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  28 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  28.17 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  27.57 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  26.62 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  27.74 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  29.48 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  26.45 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  28.52 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  29.48 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  25.61 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  27.34 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  25.98 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  27.74 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  27.34 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  28.51 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.82 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  26.99 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  29.37 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  33.1 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  26.67 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  26.53 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.09 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  26.23 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  26.74 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  26.28 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  26.28 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  26.28 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  26.82 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  26.09 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  28.47 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  26.17 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  26.28 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  26.28 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  26.28 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  26.71 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  25.25 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4446  hypothetical protein  27.59 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  26.14 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  28.29 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  26.13 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.29 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  27.08 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  25.62 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  26.55 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  26.46 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  26.96 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  27.27 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  28.12 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  26.96 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  26.96 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  26.96 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3207  hypothetical protein  27.53 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  26.81 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  25.76 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  27.82 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4953  hypothetical protein  27.53 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  26.96 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  26.19 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  23.58 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>