More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1376 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
252 aa  522  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  64.8 
 
 
251 aa  332  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.35 
 
 
867 aa  311  5.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.59 
 
 
253 aa  270  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.4 
 
 
253 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.41 
 
 
254 aa  267  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  54.8 
 
 
249 aa  262  4e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.42 
 
 
251 aa  262  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.42 
 
 
251 aa  261  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.84 
 
 
254 aa  261  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.84 
 
 
254 aa  259  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.61 
 
 
254 aa  255  5e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.81 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.39 
 
 
264 aa  252  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.79 
 
 
257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.39 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.39 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.34 
 
 
260 aa  242  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.39 
 
 
257 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.39 
 
 
257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.8 
 
 
258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.77 
 
 
251 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.41 
 
 
261 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.02 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.18 
 
 
610 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.19 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.58 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.95 
 
 
248 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.4 
 
 
256 aa  227  2e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.19 
 
 
257 aa  225  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  46.56 
 
 
614 aa  223  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.15 
 
 
255 aa  223  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  46.77 
 
 
271 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.53 
 
 
250 aa  219  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.02 
 
 
252 aa  218  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.97 
 
 
244 aa  216  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.63 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.53 
 
 
626 aa  216  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.48 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.98 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.22 
 
 
257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.95 
 
 
626 aa  210  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 
268 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.04 
 
 
262 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.77 
 
 
261 aa  208  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1078  hypothetical protein  47.5 
 
 
237 aa  207  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.4 
 
 
252 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0301  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.43 
 
 
260 aa  203  2e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0342995  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.05 
 
 
259 aa  203  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.15 
 
 
257 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2705  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.98 
 
 
308 aa  202  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  hitchhiker  0.000105231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.41 
 
 
272 aa  201  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.74 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2523  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.57 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0144072  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1039  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.17 
 
 
266 aa  199  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0255255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1166  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.77 
 
 
266 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.4 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0969  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.77 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3211  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.96 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.4 
 
 
958 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.71 
 
 
261 aa  196  3e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.37 
 
 
247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.82 
 
 
262 aa  195  5.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
269 aa  194  8.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 
252 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.16 
 
 
283 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.92 
 
 
271 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 
249 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4305  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.15 
 
 
257 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.31 
 
 
264 aa  192  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.52 
 
 
253 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 
260 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0627  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-4 C11-methyltransferase  43.93 
 
 
242 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05141  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  40.4 
 
 
252 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  0.388015 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.5 
 
 
273 aa  189  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  39.76 
 
 
250 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1791  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.49 
 
 
250 aa  188  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  44.81 
 
 
240 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0510  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.54 
 
 
238 aa  188  7e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.56 
 
 
260 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.84 
 
 
266 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.73 
 
 
254 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2812  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.73 
 
 
266 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.44 
 
 
251 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.44 
 
 
262 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.39 
 
 
281 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.76 
 
 
243 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.39 
 
 
275 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.56 
 
 
260 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.24 
 
 
259 aa  186  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.16 
 
 
260 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.11 
 
 
253 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.92 
 
 
248 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5844  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.77 
 
 
292 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.903403 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0806  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  39.68 
 
 
273 aa  184  8e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>