More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0714 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0714  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 167 aa  330  6e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000638599  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 157 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  44.53 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  36.73 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  37.84 
 
 		 158 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 158 aa  94.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  39.19 
 
 		 203 aa  94  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  37.84 
 
 		 158 aa  94  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  39.19 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  38.97 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  38.69 
 
 		 156 aa  93.2  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  35.14 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  37.96 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1471  transcription elongation factor GreA  40.71 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.190559  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1270  transcription elongation factor GreA  40.71 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  39.19 
 
 		 158 aa  91.3  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  38.24 
 
 		 159 aa  90.9  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  39.33 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  39.26 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  39.71 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  37.84 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  37.84 
 
 		 157 aa  87.8  6e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 156 aa  87.8  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 160 aa  87.4  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  37.32 
 
 		 158 aa  87.4  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 		 162 aa  87  9e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  36.69 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  34.04 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  36.03 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  36.76 
 
 		 154 aa  85.9  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  34.93 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  34.93 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  35.14 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  35.37 
 
 		 160 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  35.37 
 
 		 160 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  38.84 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  34.69 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  35.37 
 
 		 160 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 162 aa  84  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  35.14 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  35.77 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  34.25 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  32.89 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  35.97 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  35.77 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  35.77 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  34.69 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  34.42 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  39.06 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  37.59 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  33.11 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  37.96 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  38.35 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  38.76 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  34.56 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  34.56 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  34.56 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  34.56 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  34.56 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  36.3 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  36.49 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  37.68 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  37.68 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  34.46 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  31.54 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  33.82 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  34.01 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  30.82 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  33.82 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1784  transcription elongation factor GreA  38.17 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.867694  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  34.23 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  35.34 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  39.29 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  32.61 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  36.44 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  32.65 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  33.78 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  35.04 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  38.81 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  36.73 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  34.23 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  34.92 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  34.25 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  36.03 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  39.23 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>