236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0499 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  47.45 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  43.5 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  40.29 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  44.34 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  39.72 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  39.72 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  39.25 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.25 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.25 
 
 		 211 aa  157  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  39.81 
 
 		 211 aa  157  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  39.81 
 
 		 211 aa  157  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  39.44 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  39.09 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  39.32 
 
 		 211 aa  154  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.85 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  37.85 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.76 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  46.34 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  37.37 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  41.67 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  38.66 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  41.76 
 
 		 211 aa  144  9e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  44.72 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  38.66 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  45.59 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  36.92 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  44.12 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  40.1 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  41.58 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  39.36 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  39.06 
 
 		 206 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  35.02 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  36.28 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  36.68 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  40.31 
 
 		 208 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  36 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  34.76 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  44.53 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  37 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  40.61 
 
 		 192 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  35.38 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  34.48 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  38.38 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  40.57 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  40.57 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  39.25 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  36.75 
 
 		 203 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  50.86 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  35.96 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  39.39 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  36.56 
 
 		 274 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  39.27 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  37.62 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  34.95 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  34.72 
 
 		 203 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  43.45 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  34.76 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  38.73 
 
 		 206 aa  118  7e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0960  hypothetical protein  36.27 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239073  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  34.22 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  37.06 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  36.11 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  34.27 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  33.71 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  34.04 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  34.24 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  32.52 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  32.2 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  33.67 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  36.71 
 
 		 203 aa  112  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  35.2 
 
 		 198 aa  112  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  41.72 
 
 		 197 aa  111  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  38.71 
 
 		 192 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  39.75 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  34.85 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  35.96 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  35.96 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  35.96 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  35.96 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  32.11 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2997  protein of unknown function UPF0029  40.91 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  34.08 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  35.26 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  36.22 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  31.58 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  35.68 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  40.59 
 
 		 200 aa  108  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  33.54 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  35.14 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  30.5 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  32 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  32.99 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0903  protein of unknown function UPF0029  41.18 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.30398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  37.42 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  35.75 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  34.22 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3285  protein of unknown function UPF0029  34.97 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.897292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  37.1 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  34.05 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>