More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2528 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
670 aa  1370    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  58.41 
 
 
680 aa  786    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  49.47 
 
 
673 aa  646    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.21 
 
 
673 aa  665    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.63 
 
 
680 aa  643    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  51.69 
 
 
684 aa  669    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0049  penicillin-binding protein 3  47.05 
 
 
663 aa  591  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0588264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.56 
 
 
662 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.77 
 
 
654 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  37.13 
 
 
660 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.01 
 
 
657 aa  362  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  34.69 
 
 
657 aa  360  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  36.33 
 
 
657 aa  355  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  35.95 
 
 
656 aa  350  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.61 
 
 
689 aa  349  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  37.75 
 
 
657 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  35.7 
 
 
705 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  34.05 
 
 
713 aa  318  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  36.04 
 
 
711 aa  308  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 
586 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  36.14 
 
 
675 aa  302  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.96 
 
 
675 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.83 
 
 
708 aa  296  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  35.32 
 
 
675 aa  296  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 
675 aa  296  9e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.11 
 
 
645 aa  296  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  30.63 
 
 
695 aa  295  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 
582 aa  294  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.58 
 
 
570 aa  293  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  34.53 
 
 
708 aa  291  4e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 
672 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  32.04 
 
 
682 aa  290  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 
654 aa  289  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 
690 aa  289  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  34.56 
 
 
740 aa  287  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.3 
 
 
644 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.33 
 
 
703 aa  284  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  35.31 
 
 
708 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  32.15 
 
 
671 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  33.1 
 
 
631 aa  281  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 
578 aa  280  5e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  32.68 
 
 
729 aa  277  4e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  32.21 
 
 
644 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  33.58 
 
 
727 aa  276  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  32.16 
 
 
638 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  32.16 
 
 
638 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  32.01 
 
 
638 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  32.01 
 
 
638 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  32.01 
 
 
638 aa  273  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.64 
 
 
710 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  31.85 
 
 
638 aa  272  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  32.16 
 
 
638 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  32.09 
 
 
579 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  31.85 
 
 
638 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  32.09 
 
 
579 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  33.21 
 
 
587 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  31.85 
 
 
638 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 
723 aa  271  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  32.01 
 
 
638 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  32.92 
 
 
583 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  31.49 
 
 
638 aa  269  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  32.56 
 
 
578 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  34.58 
 
 
586 aa  267  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  32.53 
 
 
583 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  32.53 
 
 
583 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  32.53 
 
 
583 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  32.37 
 
 
646 aa  266  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 
582 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  32.03 
 
 
582 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0866  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
562 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.07417  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  34.22 
 
 
575 aa  263  8e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  33.1 
 
 
575 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 
578 aa  262  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  32.24 
 
 
649 aa  262  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  32.26 
 
 
577 aa  260  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  32.1 
 
 
610 aa  259  9e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  31.32 
 
 
579 aa  259  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  31.84 
 
 
583 aa  259  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.97 
 
 
702 aa  259  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 
578 aa  259  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 
638 aa  259  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  32.33 
 
 
653 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  31.85 
 
 
578 aa  259  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  32.01 
 
 
583 aa  258  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 
553 aa  258  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.47 
 
 
588 aa  257  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 
584 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 
584 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.71 
 
 
571 aa  257  6e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 
584 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 
584 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  31.56 
 
 
585 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.03 
 
 
614 aa  254  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 
582 aa  253  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  30.16 
 
 
734 aa  253  8.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.6 
 
 
561 aa  253  9.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  31.25 
 
 
728 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  32.32 
 
 
594 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  31.84 
 
 
622 aa  252  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.32 
 
 
594 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>