More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1207 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  100 
 
 		 311 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  73.95 
 
 		 311 aa  500  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  72.03 
 
 		 311 aa  494  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  73.63 
 
 		 311 aa  488  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  72.67 
 
 		 311 aa  484  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  71.06 
 
 		 311 aa  484  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  71.7 
 
 		 311 aa  474  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  59.6 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  58.94 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  58.94 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  60.33 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  58.61 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  58.14 
 
 		 319 aa  363  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  58.94 
 
 		 314 aa  361  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  57.28 
 
 		 332 aa  352  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  56.29 
 
 		 314 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  54.93 
 
 		 348 aa  348  6e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  53.55 
 
 		 318 aa  346  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  54.31 
 
 		 325 aa  346  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  54.52 
 
 		 320 aa  345  4e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  53.62 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  55.08 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  56.48 
 
 		 313 aa  339  4e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  53.97 
 
 		 312 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  51.78 
 
 		 458 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  53.05 
 
 		 316 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  53.05 
 
 		 316 aa  338  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  53.97 
 
 		 317 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  51.95 
 
 		 361 aa  337  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  53.31 
 
 		 314 aa  337  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  53.31 
 
 		 345 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  51.31 
 
 		 310 aa  336  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  52.96 
 
 		 310 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  54.43 
 
 		 324 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  52.65 
 
 		 321 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  53.97 
 
 		 321 aa  335  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  55.84 
 
 		 325 aa  335  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  53.31 
 
 		 326 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  54.43 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  54.52 
 
 		 322 aa  334  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  52.65 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  50.32 
 
 		 320 aa  332  3e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  50.32 
 
 		 320 aa  332  3e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  51.94 
 
 		 311 aa  332  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  53.62 
 
 		 319 aa  332  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  53.99 
 
 		 326 aa  332  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  53 
 
 		 327 aa  332  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  53.07 
 
 		 313 aa  331  7.000000000000001e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  52.3 
 
 		 310 aa  331  8e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  54.15 
 
 		 335 aa  331  8e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 316 aa  331  9e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  53.75 
 
 		 330 aa  331  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  53.95 
 
 		 323 aa  330  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  54.58 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  54.58 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  54.58 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  51.32 
 
 		 314 aa  330  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  51.66 
 
 		 326 aa  329  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  53.75 
 
 		 348 aa  329  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  52.43 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  53.75 
 
 		 333 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  53.31 
 
 		 321 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  54.9 
 
 		 325 aa  328  7e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  53.97 
 
 		 321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  51.44 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  50.65 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  52.33 
 
 		 320 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  51.47 
 
 		 359 aa  325  4.0000000000000003e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  51.64 
 
 		 340 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 319 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0558  thioredoxin-disulfide reductase  52.77 
 
 		 314 aa  325  5e-88  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  51.63 
 
 		 324 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  53.14 
 
 		 331 aa  325  9e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  51.8 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 317 aa  324  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  53.97 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  52.98 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  52.58 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  52.65 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  51.61 
 
 		 317 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 316 aa  323  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  53 
 
 		 315 aa  323  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  51.86 
 
 		 317 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 319 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  51.31 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  50 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  51.94 
 
 		 316 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 320 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  51.95 
 
 		 337 aa  322  7e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  51.29 
 
 		 316 aa  321  8e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 318 aa  321  8e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  53.14 
 
 		 336 aa  321  8e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  49.52 
 
 		 319 aa  321  9.000000000000001e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  48.71 
 
 		 333 aa  321  9.000000000000001e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  52.15 
 
 		 320 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3328  thioredoxin reductase  50.31 
 
 		 318 aa  320  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 317 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>