More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2170 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 155 aa  327  4e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  50.34 
 
 		 150 aa  171  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  51.35 
 
 		 155 aa  167  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  51.75 
 
 		 141 aa  150  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  43.04 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  43.14 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.42 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  41.94 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  41.94 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  42.38 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  41.94 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1422  protein tyrosine phosphatase  42.48 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0163  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.33 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  41.94 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  45.22 
 
 		 166 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 		 173 aa  126  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  44.06 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  42.58 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  40.65 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  43.54 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  44.72 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  41.1 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  44.9 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  40.65 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  42.18 
 
 		 164 aa  123  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  43.05 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  44.81 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  43.54 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  42.95 
 
 		 201 aa  121  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  39.22 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  42.31 
 
 		 201 aa  120  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  38.06 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  43.14 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.41 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 		 161 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.75 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  40.97 
 
 		 162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  38.82 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  43.33 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  41.77 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  44.68 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  38.31 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  41.06 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0851  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  39.22 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  38.51 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  42.28 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  41.78 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  43.05 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  42.47 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  42 
 
 		 171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  41.33 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  40.67 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2040  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000170102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  44.68 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  41.33 
 
 		 171 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40 
 
 		 151 aa  113  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2051  protein tyrosine phosphatase  40.65 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000114311  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  38.56 
 
 		 163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  37.58 
 
 		 188 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  38.78 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  40.94 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  36.08 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  38.31 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  36.91 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  41.33 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  38.71 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  35.76 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.38 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0675  protein tyrosine phosphatase  43.17 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.118307  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2313  protein tyrosine phosphatase  42.45 
 
 		 156 aa  110  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.019528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  38.96 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.96 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  40.27 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  38 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  41.67 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.71 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.71 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.76 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.71 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  39.73 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.71 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  41.38 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.71 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.71 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  40.14 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.71 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.71 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  36.81 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  37.84 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  35.58 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  35.37 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>