More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2051 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2051  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
156 aa  323  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000114311  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1853  protein tyrosine phosphatase  50.67 
 
 
167 aa  145  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  47.22 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  40.65 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0407  protein tyrosine phosphatase  39.26 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2040  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 
189 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000170102  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  39.35 
 
 
155 aa  103  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0391  protein tyrosine phosphatase  42.65 
 
 
182 aa  103  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558013  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  36 
 
 
174 aa  101  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 
158 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  36.31 
 
 
157 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2313  protein tyrosine phosphatase  40.29 
 
 
156 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.019528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.67 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 
173 aa  98.6  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  38.36 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  37.42 
 
 
165 aa  97.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  40.56 
 
 
162 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  38.78 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  36.54 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  35.92 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 
166 aa  95.5  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  41.84 
 
 
173 aa  94.4  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1422  protein tyrosine phosphatase  35.21 
 
 
154 aa  94  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
154 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  34.44 
 
 
165 aa  92.8  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.23 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2962  protein tyrosine phosphatase  36.77 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.502384 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  33.76 
 
 
164 aa  92  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3156  protein tyrosine phosphatase  36.77 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  34.64 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 
157 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  35.92 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  35.53 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  36.69 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
154 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  35.33 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 
150 aa  89  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  40.44 
 
 
172 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  36.05 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  36.25 
 
 
201 aa  87.8  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  36.25 
 
 
201 aa  87.4  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.58 
 
 
151 aa  87.4  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  35.76 
 
 
155 aa  87.4  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  35.04 
 
 
157 aa  87  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  33.75 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  32.45 
 
 
160 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 
175 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  37.09 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  36.81 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0163  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.6 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147103  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  36.17 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.77 
 
 
186 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1047  protein tyrosine phosphatase  36.54 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.8 
 
 
154 aa  84.3  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.67 
 
 
159 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  31.79 
 
 
160 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  31.79 
 
 
160 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  36.73 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  34.21 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  32.05 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  35.06 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.26 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  35.06 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  29.41 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  35.21 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1485  protein tyrosine phosphatase  33.79 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  32.88 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  33.77 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  35.42 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.76 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  30.38 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  31.79 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  33.57 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.69 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  35.29 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.69 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.69 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  31.69 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  31.69 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.69 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.69 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.69 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.69 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.5 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.5 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  33.77 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>