More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1965 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0630  serine hydroxymethyltransferase  82.65 
 
 		 440 aa  771    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1590  serine hydroxymethyltransferase  86.14 
 
 		 440 aa  800    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1789  serine hydroxymethyltransferase  85.39 
 
 		 438 aa  782    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1965  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 441 aa  913    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0584  serine hydroxymethyltransferase  81.65 
 
 		 440 aa  753    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130889  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0727  serine hydroxymethyltransferase  86.3 
 
 		 438 aa  789    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0601  serine hydroxymethyltransferase  85.91 
 
 		 440 aa  805    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  65.22 
 
 		 435 aa  581  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3410  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 424 aa  558  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09233  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 		 439 aa  550  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.293634  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3633  serine hydroxymethyltransferase  60.94 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3859  serine hydroxymethyltransferase  61.88 
 
 		 423 aa  545  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0275  serine hydroxymethyltransferase  60.09 
 
 		 422 aa  536  1e-151  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.246164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7293  Glycine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 		 425 aa  535  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 436 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1617  serine hydroxymethyltransferase  63.2 
 
 		 424 aa  531  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3814  serine hydroxymethyltransferase  60.79 
 
 		 433 aa  531  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.866873  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4970  Glycine hydroxymethyltransferase  61.47 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00413503  hitchhiker  0.000000000000204325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  58.72 
 
 		 436 aa  531  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_002950  PG0042  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 426 aa  504  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  56.15 
 
 		 416 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 		 415 aa  491  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  56.94 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  58.55 
 
 		 412 aa  488  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  54.97 
 
 		 410 aa  488  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  56.88 
 
 		 415 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  56.15 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  56.13 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 412 aa  484  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  57.44 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  56.15 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.64 
 
 		 415 aa  488  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  54.97 
 
 		 410 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  57.08 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  56.58 
 
 		 413 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  55.92 
 
 		 414 aa  482  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  55.45 
 
 		 418 aa  481  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  55.92 
 
 		 413 aa  481  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 410 aa  481  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  56.38 
 
 		 411 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  57.54 
 
 		 414 aa  481  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 414 aa  484  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  56.81 
 
 		 412 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  55.68 
 
 		 413 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  55.68 
 
 		 414 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  55.81 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 412 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  55.45 
 
 		 413 aa  480  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  55.84 
 
 		 420 aa  478  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  55.19 
 
 		 420 aa  481  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  55.68 
 
 		 413 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  55.66 
 
 		 411 aa  479  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  56.22 
 
 		 419 aa  476  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  56.35 
 
 		 413 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  55.84 
 
 		 422 aa  477  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  56.46 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  56.05 
 
 		 427 aa  474  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  57.51 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  55.87 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  55.87 
 
 		 417 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  55.87 
 
 		 417 aa  471  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 413 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  55.63 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  55.63 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  55.63 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  55.63 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  55.07 
 
 		 415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  53.35 
 
 		 416 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  55.07 
 
 		 412 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  54.48 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  55.63 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  54.15 
 
 		 425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  55.16 
 
 		 417 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  53.04 
 
 		 412 aa  466  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  55.4 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  53.74 
 
 		 412 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  54.69 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  54 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  54.06 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  56.84 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  55.2 
 
 		 431 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  59.48 
 
 		 412 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  53.69 
 
 		 436 aa  467  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  54.8 
 
 		 440 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  54.95 
 
 		 417 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  55.84 
 
 		 423 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  56.31 
 
 		 430 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 432 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  54.82 
 
 		 417 aa  461  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  54.29 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  55.35 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  55.14 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  54.06 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  54.69 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  53.46 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  53.27 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>